| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 536,687 | (A)9→8 | coding (636/822 nt) | unknown → | probable glucanotransferase (endo alpha‑1,4 polygalactosaminidase related protein) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 536,679 | 0 | A | . | 100.0% | 105.4 / NA | 26 | coding (628/822 nt) | unknown | probable glucanotransferase (endo alpha‑1,4 polygalactosaminidase related protein) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (17/9); total (17/9) | |||||||||||
TATGCTGATATGGGGTTGGATGGTTTTTTTCTTGATAATGCAGATGTTTATTATCATTATCAAACAAATGAGATATTTCAAGGGCTTGTAACAATTTTGACTGGGCTTCGATATTATAATATTCCACTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAATAAAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAGGCTCATGGATTATCTGTCTATTTACTTGAATATAATGCAAGTAAGGAACTGTCAAAAAAAATTGACAAATATGCAAATGAAAATGGCTTTCTTTGGTATAACGCGAAGGGATTAGAGCTTCGGTAACTCGTGTGAATGCAGATATAATA > 1/536445‑536896 | tATGCTGATATGGGGTTGGATGGTTTTTTTCTTGATAATGCAGATGTTTATTATGATTATCAAACAAATGAGATATTTCAAGGGCTTGTAACAATTTTGACTGGGCTTCGATATTATAATATTCCACTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAAT‑AAAAAAAATATGGAAt < 1:127710/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gCTTCGATATTATAATATTCCACTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAAT‑AAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAgg > 1:339639/1‑199 (MQ=255) ttatAATATTCCACTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAAT‑AAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAGGCTCATGGATTATCTGTCTATTTACTTGAATATAATGCAAGTAAGGAACTGTCAAAAAAAAt > 1:248861/1‑251 (MQ=255) cTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAAT‑AAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAGGCTCATGGATTATCTGTCTATTTACTTGAatat < 1:34314/209‑1 (MQ=255) ttaATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAAT‑AAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAGGc > 1:550461/1‑171 (MQ=255) 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TATGCTGATATGGGGTTGGATGGTTTTTTTCTTGATAATGCAGATGTTTATTATCATTATCAAACAAATGAGATATTTCAAGGGCTTGTAACAATTTTGACTGGGCTTCGATATTATAATATTCCACTTATTATTAATGGAGGGGATCTTTTTGTAAAAAAATGTATTAATCAAAATACCGTTTTAATTGATGGTATTAACCAAGAAAGTGTTTTTACCACTATTGATTTTAATAAAAAAAAATATGGAATCCAGCAGAAATCGGAAACAACCTATTTTCAAAAATATCTGGCATATGTTAAGGCTCATGGATTATCTGTCTATTTACTTGAATATAATGCAAGTAAGGAACTGTCAAAAAAAATTGACAAATATGCAAATGAAAATGGCTTTCTTTGGTATAACGCGAAGGGATTAGAGCTTCGGTAACTCGTGTGAATGCAGATATAATA > 1/536445‑536896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |