| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 23,302 | (G)5→4 | intergenic (‑53/+122) | unknown ← / ← unknown | Ferric siderophore transport system, biopolymer transport protein ExbB/Putative membrane protein YfjD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 23,298 | 0 | G | . | 100.0% | 158.9 / NA | 39 | intergenic (‑49/+126) | unknown/unknown | Ferric siderophore transport system, biopolymer transport protein ExbB/Putative membrane protein YfjD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (20/19); total (20/19) | |||||||||||
CACAGTAGAAACTATGGTGAGGTTACGGTTTAAATCAATTTCAAGTGCATAAATGGTGGAATATTGACTCACTTTAACACGGGATAAAAAGAAGAAACGTTCGATGACCATGGTGAGCATTAATACGCTCATAAACAGTAATAAACCGATAATAATGTAGTCACTATAATTTTGTAAGAATTCAAAAATTTGTGGCATTTGCTTTTCCTTTTTAAATGTGATCTGTTTAAATAAATAGTAGAAAGAGGGGGCAGATCATACCCCTTCCATAACTGATAATCAATCTCATTTATTGTAAAAAAATCTGCGCTTCTTTTTTTAAAAAAAGCGATAAAAACACTTGATCGTTTCTGATTACGTAAACACAAATTCTTATAATTTAATAACCTTCGCCCGCTTAATCATATTCTCACTCACTTCCAACACGGTAACCTGCAAGCCATTAAGTTCACAGACTGTGCCTTCGTGTGGGATTTCTTCCAAATG > 4/23052‑23537 | cacaGTAGAAACTATGGTGAGGTTACGGTTTAAATCAATTTCAAGTGCATAAATGGTGGAATATTGACTCACTTTAACACGGGATAAAAAGAAGAAACGTTCGATGACCATGGTGAGCATTAATACGCTCATAAACAGTAATAAACCGATAATAATGTAGTCACTATAATTTTGTAAGAATTCAAAAATTTGTGGCATTTGCTTTTCCTTTTTAAATGTGATCTGTTTAAATAAATAGTAGAAAGAggggc < 1:218906/251‑2 (MQ=255) 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CACAGTAGAAACTATGGTGAGGTTACGGTTTAAATCAATTTCAAGTGCATAAATGGTGGAATATTGACTCACTTTAACACGGGATAAAAAGAAGAAACGTTCGATGACCATGGTGAGCATTAATACGCTCATAAACAGTAATAAACCGATAATAATGTAGTCACTATAATTTTGTAAGAATTCAAAAATTTGTGGCATTTGCTTTTCCTTTTTAAATGTGATCTGTTTAAATAAATAGTAGAAAGAGGGGGCAGATCATACCCCTTCCATAACTGATAATCAATCTCATTTATTGTAAAAAAATCTGCGCTTCTTTTTTTAAAAAAAGCGATAAAAACACTTGATCGTTTCTGATTACGTAAACACAAATTCTTATAATTTAATAACCTTCGCCCGCTTAATCATATTCTCACTCACTTCCAACACGGTAACCTGCAAGCCATTAAGTTCACAGACTGTGCCTTCGTGTGGGATTTCTTCCAAATG > 4/23052‑23537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |