| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 929,767 | Δ1 bp | intergenic (+73/‑15) | unknown → / → unknown | Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family/Ribosome‑binding factor A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 929,766 | 0 | A | . | 100.0% | 367.1 / NA | 86 | intergenic (+72/‑16) | unknown/unknown | Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family/Ribosome‑binding factor A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (49/37); total (49/37) | |||||||||||
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1:876734/1‑251 (MQ=255) | TTTCAAAATTACGCAAACAACTTCGTAAAGCACGCAACGAGATTGATGATGTGCAAGATGAAATTCAAGAAGAGGAATCTAGATTACTTAAGGCATTGAAGGCAAAAGTACAGCAAACCATGGATAATCAATCGGTGTTTTTGATTCAGTGGAAAATCCTTTAGTATTTCACCGCACTTTTATGCTTTTTCCGTGCTAATTGAAGGGAATTTAAGTAGAATAGAGCGCCTTTAATAAGAAGGATAATGATAATGGCTCGAGAATTCAAACGTAGCGACCGTGTCGCACAAGAAATCCAAAAAGAAATCGCGGTGATTTTACAACGCGAAGTGAAAGATCCCCGAATCGGCATGGTGACGGTGTCCGATGTGGACGTTTCCAGTGATTTGGCGTATGCCAAAGTGTTCGTCACGTTCTTGTTTGATCATGATGAACAAGCGATCGCACAAGGCATGAAAGGCTTGGAAAAAGCCGCGCCTTAT > 1/929531‑930012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |