| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 895,637 | 2 bp→AA | intergenic (‑25318/‑1343) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/36); total (38/36) | |||||||||||
| * | 1 | 895,638 | 0 | G | A | 100.0% | 211.4 / NA | 74 | intergenic (‑25319/‑1343) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/36); total (38/36) | |||||||||||
CGTTGAAAATTCATTGGAAAATCTGACCGCACTTTTAGGCTGTGACGCGCAGCAATTGCAACAGGAAATCCTCCAATTGGAGCAGCAGGGGATATGTTTTGAGGTGGAAAACGGTCATCTTTATTTGATCCCCGAAATGCCGCTATTAGATGAAGCACGTTTGACACAAGCTTTAGCGCCTTATGGCGTAACGCTTAAACCGGTGATTTCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGGGCAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAGCTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTACGGATTCCAAGTGAAATGGCCGAACGATATTTTAGTTAATG > 1/895395‑895879 || cgTTGAAAATTCATTGGAAAATCTGACCGCACTTTTAGGCTGTGACGCGCAGCAATTGCAACAGGAAATCCTCCAATTGGAGCAGCAGGGGATATGTTTTGAGGTGGAAAACGGTCATCTTTATTTGATCCCCGAAATGCCGCTATTAGATGAAGCACGTTTGACACAAGCTTTAGCGCCTTATGGCGTAACGCTTAAACCGGTGATTTCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGAACAGTTa < 1:141314/250‑1 (MQ=255) 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ttAAACCGGTGATTTCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGAACAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAACTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTAc < 1:787266/251‑1 (MQ=255) ccGGTGATTTCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGAACAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAGCTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTACGGAtt > 1:788439/1‑251 (MQ=255) ttCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGAACAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGAc > 1:300453/1‑92 (MQ=255) ttCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGAACAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAGCTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTACGGATTCCAAGTGa > 1:442672/1‑251 (MQ=255) 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1:297287/1‑181 (MQ=255) tCACTTGGAACAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAGCTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTACGGATTCCAAGTGAAATGGCCGAACGATATTTTAGTTAATg < 1:277620/251‑1 (MQ=255) || CGTTGAAAATTCATTGGAAAATCTGACCGCACTTTTAGGCTGTGACGCGCAGCAATTGCAACAGGAAATCCTCCAATTGGAGCAGCAGGGGATATGTTTTGAGGTGGAAAACGGTCATCTTTATTTGATCCCCGAAATGCCGCTATTAGATGAAGCACGTTTGACACAAGCTTTAGCGCCTTATGGCGTAACGCTTAAACCGGTGATTTCCTCGACTAACCAATATTTGTTGGATCACTTGGGGCAGTTACAAAAGGGGGATTTATGCTTGGCGGAATATCAAACCACAGGGCGTGGACGCCGTGGCAGACAATGGATTTCACCCTTTGCAGGGCAAATAATCATGAGTTTTTATTGGCAGCTGAATCCAACAAAATCTCTGGATGGATTGAGCTCGGTGATTGGTCTTGCCATTGTTCAAGCATTGGCGGAGTTGGATATGTACGGATTCCAAGTGAAATGGCCGAACGATATTTTAGTTAATG > 1/895395‑895879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |