| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,293,993 | 3 bp→GAA | intergenic (+154863/+99316) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,293,993 | 0 | T | G | 100.0% | 48.2 / NA | 18 | intergenic (+154863/+99318) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (8/10); total (8/10) | |||||||||||
| * | 1 | 1,293,994 | 0 | T | A | 100.0% | 49.2 / NA | 18 | intergenic (+154864/+99317) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (8/10); total (8/10) | |||||||||||
| * | 1 | 1,293,995 | 0 | T | A | 100.0% | 48.6 / NA | 18 | intergenic (+154865/+99316) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (8/10); total (8/10) | |||||||||||
CAGCTATCCAATTTTATTAAGACGGATAAAGGCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACACTTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTTCATCACGTTTAACTAGTAATAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGTCACTAATTTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGGTTTGCTCTCTTTAAAAATGACTGGGTAAAAAAATTTATTTCTTGAAGATTTGATTTTTTGAGCGTTTATGATGATGAGATATTCGTGAGTTTTTAGAGGTAGGTGAAAATACTTC > 1/1293772‑1294180 ||| aaatttcccgcccctgcaaatacccctaaagccacgtaataactgctgactagataatgcgatacgtgcttgaatttatgcttacatTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATAtatta < 1:358946‑M2/164‑1 (MQ=255) tttcccgcccctgcaaatacccctaaagccacgtaataactgctgattagataatgcgatacgtgcttgaatttatgcttacatTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGt < 1:641107‑M2/167‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |