| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 933,685 | A→G | intergenic (‑8968/‑181423) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 933,685 | 0 | A | G | 100.0% | 116.3 / NA | 41 | intergenic (‑8968/‑181423) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/25); total (16/25) | |||||||||||
CGGCAGAACGCACCGCACTTTACGGACGAATCGAGCAAATCCTGCAAGAGGAAAATGTGGTTCTGCCGTTATATCAATCCACCGTTCCCGTCTATCTCAACCCCACACTAAACGGCTACGACCCCGCCAACCCGACGGAAGTTATTTATAGCAAGGATTTGTTTCGTAAGGTTAGATAATGTGCTGATAAAATTTAACTACATGCCTTAATAAATACTCAAAGCCTATTGAAATCGGTCAACAGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAACAAAGCCAACGCCGGGTGGAAAATGTACGGATAATACGGTAATGGAACACTTTTTTGTAGTTTAAAGACGGATAAACTTTATTGTGAAAACGATGCCATTTTGTCTTTGTGATATTACAAATTTTTGAATCGTTACACTAATCATCCAATCCATTCAACGC > 1/933443‑933919 | cGGCAGAACGCACCGCACTTTACGGACGAATCGAGCAAATCCTGCAAGAGGAAAATGTGGTTCTGCCGTTATATCAATCCACCGTTCCCGTCTATCTCAACCCCACACTAAACGGCTACGACCCCGCCAACCCGACGGAAGTGATTTATAGCAAGGATTTGTTTCGTAAGGTTAGATAATGTGCTGATAAAATTTAACTACATGCCTTAATAAATACTCAAAGCCTATTGAAATCGGTCAACGGGCttttt < 1:548921/251‑1 (MQ=255) 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1:528891/1‑250 (MQ=255) cTCAAAGCCTATTGAAATCGGTCAACGGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAAc > 1:396524/1‑101 (MQ=255) cTCAAAGCCTATTGAAATCGGTCAACGGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAACAAAGCCAACGCCGGGTGGAAAATGTACGGATAATACGGTAATGGAACACTTTTTTGTAGTTTAAAGACGGATAAACTTTATTGTGAAAACGATGCCATTTTGTCTTTGTGATATTACAAATTTTTGAATCGTTACACTAatcatc < 1:856561/246‑1 (MQ=255) aTTGAAATCGGTCAACGGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAACAAAGCCAACGCCGGGTGGAAAATGTACGGATAATACGGt < 1:465175/130‑1 (MQ=255) aTTGAAATCGGTCAACGGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAACAAAGCCAACGCCGGGTGGAAAATGTACGGATAATACGGTAATGGaa < 1:547983/137‑1 (MQ=255) aTTGAAATCGGTCAACGGGCTTTTTTATCCGGATATTCATTATTCCATACTTGACGTATCATTTAATTGAATAATCTTCTTAGTATAAAACAAAGCCAACGCCGGGTGGAAAATGTACGGATAATACGGTAATGGAACACTTTTTTGTAGTTTAAAGACGGATAAACTTTATTGTGAAAACGATGCCATTTTGTCTTTGTGATATTACAAATTTTTGAATCGTTACACTAATCATCCAATCCATTCAACg > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |