| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 924,784 | T→G | intergenic (‑67/‑190324) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 924,784 | 0 | T | G | 100.0% | 194.1 / NA | 66 | intergenic (‑67/‑190324) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (28/38); total (28/38) | |||||||||||
GTCAGTTTGTATTGAAAAACACCGGGAATTCTGACCGACTTTTCAGTCTCAAGGTCGCGCACAGAATAAAAAATCCCTCGCTGAAAGGCGAGGGATTGTAAATTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTCACATAAAACGAATGAGACGGCATTATACGAATATTTTTGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGTAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAG > 1/924538‑925023 | gcatgTTTGTATTGAAAAACACCGGGAATTCTGACCGACTTTTCAGTCTCAAGGTCGCGCACAGAATAAAAAATCCCTCGCTGAAAGGCGAGGGATTGTAAATTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTCACATAAAACGAATGAGACGGCATTATACGAATATTTTTGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGGaaa < 1:478102/246‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tttttGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGc > 1:873773/1‑241 (MQ=255) ttttGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCa < 1:22736/251‑1 (MQ=255) tttGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTtatat < 1:713209/49‑1 (MQ=255) gtgcagtgcaAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATg < 1:98007/165‑1 (MQ=255) gtgcaAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTAt > 1:330876/1‑134 (MQ=255) gtgcaAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGc < 1:816984/139‑1 (MQ=255) gtgcaAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAg > 1:148358/1‑226 (MQ=255) caAGTATAAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAAc < 1:834523/250‑1 (MQ=255) ataAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAg > 1:801227/1‑251 (MQ=255) ataAAATCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAg < 1:405479/251‑1 (MQ=255) aTCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAAc > 1:31277/1‑240 (MQ=255) aTCGTGGAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAAc < 1:437217/240‑1 (MQ=255) | GTCAGTTTGTATTGAAAAACACCGGGAATTCTGACCGACTTTTCAGTCTCAAGGTCGCGCACAGAATAAAAAATCCCTCGCTGAAAGGCGAGGGATTGTAAATTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTCACATAAAACGAATGAGACGGCATTATACGAATATTTTTGTGCAGTGCAAGTATAAAATCGTGTAAATTACGCGCTTGTTTATATATTCGACGATTTAGTCCATCTTCAAAAAATGTTCACGATAATAGGCTAACTCTTTGATAGATTCACGAATATCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAG > 1/924538‑925023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |