| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 919,198 | A→G | intergenic (+17088/+5444) | unknown → / ← unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 919,198 | 0 | A | G | 100.0% | 119.1 / NA | 42 | intergenic (+17088/+5444) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (17/25); total (17/25) | |||||||||||
ATAAAAAAATTAATAGATAAAGGAGTGGTGTTATAACATTCGATATGGTGAATGCGGTGTTCCAATCGGTGAAAATAGAAGCAAGCAGGGCTACCCCGGCTAATGGAATATCCACAACTCTGGACCAGTGCATGATAACGCCGTCTTGTGGGTTAAATTGAGGATCCGGCAGTAAATACCAATTCCCATTTTTTAACCACTCACTATATTGATGATAGCGCATAAGATCATCAGTATCACTCAATGCGAAATTTGCGACATCACTCCAGTTCCGTATAATTAAAAAAGTGGCACATAATATCCAAATAATACAAGCGATATAAACTAATTTTTTTATGTTATTATTTATAAATAATTTATTATACATATTAACCTTTTTAGTGTTTAATTATTACTTATTATTTCGAAAAATAATATATCTGGAATATAAAAAACCTAGGATTAGGCTTATACCGGAA > 1/918960‑919417 | ataaAAAAATTAATAGATAAAGGAGTGGTGTTATAACATTCGATATGGTGAATGCGGTGTTCCAATCGGTGAAAATAGAAGCAAGCAGGGCTACCCCGGCTAATGGAATATCCACAACTCTGGACCAGTGCATGATAACGCCGTCTTGTGGGTTAAATTGAGGATCCGGCAGTAAATACCAATTCCCATTTTTTAACCACTCACTATATTGATGATAGCGCATAAGATCATCAGTATCGCTCAATGCGaaa > 1:308377/1‑251 (MQ=255) 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1:31549/87‑1 (MQ=255) | ATAAAAAAATTAATAGATAAAGGAGTGGTGTTATAACATTCGATATGGTGAATGCGGTGTTCCAATCGGTGAAAATAGAAGCAAGCAGGGCTACCCCGGCTAATGGAATATCCACAACTCTGGACCAGTGCATGATAACGCCGTCTTGTGGGTTAAATTGAGGATCCGGCAGTAAATACCAATTCCCATTTTTTAACCACTCACTATATTGATGATAGCGCATAAGATCATCAGTATCACTCAATGCGAAATTTGCGACATCACTCCAGTTCCGTATAATTAAAAAAGTGGCACATAATATCCAAATAATACAAGCGATATAAACTAATTTTTTTATGTTATTATTTATAAATAATTTATTATACATATTAACCTTTTTAGTGTTTAATTATTACTTATTATTTCGAAAAATAATATATCTGGAATATAAAAAACCTAGGATTAGGCTTATACCGGAA > 1/918960‑919417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |