| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 912,184 | T→A | intergenic (+10074/+12458) | unknown → / ← unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 912,184 | 0 | T | A | 100.0% | 143.5 / NA | 51 | intergenic (+10074/+12458) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (18/33); total (18/33) | |||||||||||
AAAATATTGTCTTGAGCGGATTTCGTGAGCAGTTGAAATTCATTTAAATCATCCGTATTTTTTTGTGAATCAAAAAGGCAATGCACGATAGTGGCATGATTCAATCCATGATTTTTCATGTGATGAGGGATTATCAGGCTTATCAGACGCAAAAAGTGCGGTGGAAATTTCCGCAGAATCCACCGCACTTTGGCTTAAATTATTGAGTAAAGGGTTCAATATTTTCAGCTTCGTTATTCTGCCTGAGCTTCAACATTGTTTTCGGCAGGAGTAGTTTCTTGCTGTTGTCCCTGATGTTGCTGCTGTTGGTTAGCATTGTGATGGGCGACGGAACGCGCCGGTACAACAGTCGAGATGGCGTGTTTATAAACCATTTGATTTACTGTGTTTTTCAGTAAAATCACGAATTGATCGAATGACTCGATTTGCCCCTGTAATTTGATACCGTTTACC > 1/911941‑912393 | aaaaTATTGTCTTGAGCGGATTTCGTGAGCAGTTGAAATTCATTTAAATCATCCGTATTTTTTTGTGAATCAAAAAGGCAATGCACGATAGTGGCATGATTCAATCCATGATTTTTCATGTGATGAGGGATTATCAGGCTTATCAGACGCAAAAAGTGCGGTGGAAATTTCCGCAGAATCCACCGCACTTTGGCTTAAATTATTGAGTAAAGGGTTCAATATTTTCAGCTTCGTTATTCTGCCAGAGCtt > 1:475803/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |