| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 894,964 | 0 | T | C | 100.0% | 298.5 / NA | 97 | intergenic (‑24645/‑2017) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/53); total (44/53) | |||||||||||
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1:635830/249‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTGCGCAATGGCTTTTAATTCGCTGATGGTTAAATTAGGCGGAACGGTAATCGGATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGt < 1:53037/251‑1 (MQ=255) tttttGCGCAATGGCTTTTAATTCGCTGATGGTTAAATTAGGCGGAACGGTAATCGGATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGc > 1:276164/1‑143 (MQ=255) ttttGCGCAATGGCTTTTAATTCGCTGATGGTTAAATTAGGCGGAACGGTAATCGGATCCGACGCCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGTTGGGt < 1:171072/251‑1 (MQ=255) ggCTTTTAATTCGCTGATGGTTAAATTAGGCGGAACGGTAATCGGATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTa > 1:12785/1‑184 (MQ=255) 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gATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGTTGGGTGGAAAGATTAGCAGTGTTCGGTAACACGGTAGAATg < 1:718446/232‑1 (MQ=255) gATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGTTGGGTGGAAAGATTAGCAGTGTTCGGTAACACGGTAGAATGAGCGGGCAGGAGAAGAAcg > 1:728886/1‑251 (MQ=255) aTCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACCTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGTTGGGTGGAAAGATTAGCAGTGTTCGGTAACACGGTAGAATGAGCGGGCAGGAGAAGAAcgt > 1:592079/1‑251 (MQ=255) 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TCTTTAACGGTTACCAAACGATCTTTCGGCGTCATAAAATCGGCAACGGTTTTATTGACATTGGATACGAAACGAATGTCACGACCGGTAATAATGCCCACTAAATTGTTGTCGGCATCTACCACGGGATAACCCGCGAAGCCGTTTTTTTGCGCAATGGCTTTTAATTCGCTGATGGTTAAATTAGGCGGAACGGTAATCGGATCCGACACCACGCCGCTTTCAAATTTTTTCACTTTACGCACGCGGTCCACCTGGCGTTCGATCGTCATGTTTTTATGAATAAAGCCAATACCGCCTTCTTGCGCTAATGAAATTGCTAATTTGGCTTCAGTCACAGTATCCATGGCGGCGGATAACATTGGAATGTTCAGGCGGATGGTGGAAGTGAGTTGGGTGGAAAGATTAGCAGTGTTCGGTAACACGGTAGAATGAGCGGGCAGGAGAAGAACGTCGTCAAACGT > 1/894728‑895191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |