| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 858,385 | T→C | intergenic (+41187/+11643) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 858,385 | 0 | T | C | 100.0% | 229.0 / NA | 76 | intergenic (+41187/+11643) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (42/34); total (42/34) | |||||||||||
GTATTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGTAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCGGCATTTTGTAGCCGACG > 1/858138‑858628 | gTATTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGa > 1:460840/1‑251 (MQ=255)gTATTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGa > 1:792963/1‑251 (MQ=255) aTTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAAt < 1:107171/251‑1 (MQ=255) aTTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAAt > 1:461972/1‑251 (MQ=255) tGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATgg < 1:58555/250‑1 (MQ=255) gCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGtt < 1:120744/250‑1 (MQ=255) gCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGtt < 1:591665/250‑1 (MQ=255) gcgcgcGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGAtc < 1:459636/250‑1 (MQ=255) gcgcgcGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGAtc > 1:390445/1‑250 (MQ=255) cgTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGAtccggtcc < 1:514959/251‑1 (MQ=255) ttCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGAtccggtccgg > 1:631190/1‑251 (MQ=255) cTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGa < 1:624526/250‑1 (MQ=255) tCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAAt < 1:28753/251‑1 (MQ=255) gTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTa > 1:498295/1‑251 (MQ=255) gTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTa > 1:470154/1‑251 (MQ=255) gTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTa > 1:166342/1‑251 (MQ=255) aTGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGc < 1:743904/251‑1 (MQ=255) aTTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGc > 1:794034/1‑248 (MQ=255) tGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGAc < 1:216980/251‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGtt > 1:707256/1‑195 (MQ=255) cAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGActtctt > 1:601490/1‑250 (MQ=255) cGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGa < 1:197408/250‑1 (MQ=255) tGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATg > 1:547458/1‑250 (MQ=255) tGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATg > 1:95096/1‑250 (MQ=255) tGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGc < 1:1568/251‑1 (MQ=255) gCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGAtccggtcc < 1:525370/202‑1 (MQ=255) gCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTg > 1:683822/1‑251 (MQ=255) gCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTATTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTg > 1:814420/1‑251 (MQ=255) ttGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATg < 1:336723/251‑1 (MQ=255) ttGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATg < 1:207085/251‑1 (MQ=255) tGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGt < 1:60823/251‑1 (MQ=255) gAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGt < 1:87585/250‑1 (MQ=255) gAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTa > 1:470907/1‑251 (MQ=255) gAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTa > 1:76931/1‑251 (MQ=255) tGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTcg > 1:70647/1‑250 (MQ=255) tGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTcg > 1:777091/1‑250 (MQ=255) tATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCa < 1:223409/251‑1 (MQ=255) ctactTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTg > 1:877970/1‑250 (MQ=255) tactTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGtt > 1:133201/1‑163 (MQ=255) tactTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCAGGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAGGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGAGGTAGTGGCGGCAGGTTTGCg > 1:826002/1‑251 (MQ=255) actTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGtt < 1:661154/162‑1 (MQ=255) actTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGtt < 1:727421/246‑1 (MQ=255) actTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCgg > 1:419520/1‑251 (MQ=255) tgatgaGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTAc > 1:726026/1‑164 (MQ=255) tgatgaGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCaa > 1:749008/1‑251 (MQ=255) gTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTgg < 1:871682/174‑1 (MQ=255) gaATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACAt < 1:359166/249‑1 (MQ=255) ccATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCa > 1:529045/1‑204 (MQ=255) gttgttAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATgg < 1:400546/115‑1 (MQ=255) gttgttAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGt < 1:890274/190‑1 (MQ=255) ttgttAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGccc < 1:689797/251‑1 (MQ=255) gttAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCgg > 1:709197/1‑251 (MQ=255) ttAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCATGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTa < 1:362258/251‑1 (MQ=255) aaaaCATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATc < 1:654548/251‑1 (MQ=255) gAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACg > 1:592487/1‑251 (MQ=255) aaaaCACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATg < 1:101536/156‑1 (MQ=255) acacacCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGGAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCtt > 1:220619/1‑250 (MQ=255) cACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTg > 1:405949/1‑184 (MQ=255) gTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGccc > 1:146950/1‑188 (MQ=255) gTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGcc < 1:774077/217‑1 (MQ=255) gTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTc > 1:809986/1‑250 (MQ=255) cGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTa < 1:393469/200‑1 (MQ=255) tttCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATg > 1:233973/1‑251 (MQ=255) ttCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGTGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCt > 1:313007/1‑220 (MQ=255) cGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGtt > 1:632932/1‑251 (MQ=255) tttttACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATg > 1:755466/1‑106 (MQ=255) tttttACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCa < 1:92580/236‑1 (MQ=255) tttttACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCg > 1:721582/1‑251 (MQ=255) tttttACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCg > 1:361182/1‑251 (MQ=255) tttttACACGGCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCg > 1:39095/1‑251 (MQ=255) gCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGt < 1:393868/232‑1 (MQ=255) gCAAATGGGTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCGGCATTTTGTa > 1:575957/1‑251 (MQ=255) gTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTAtt < 1:731721/215‑1 (MQ=255) gTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTc < 1:370312/216‑1 (MQ=255) gTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCGGCATTTTGTAGCCGACg > 1:465659/1‑250 (MQ=255) gTCTTGCAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCGGCATTTTGTAGCCGACg > 1:893022/1‑250 (MQ=255) | GTATTTAGTGGCTTTCAAATGGCGCGCGTTCGTCGCGCTCATCGTTTAAGCCATGATTTTGAAGCCAGCGTGCCTGCTTTGAGTTTGATTATGCAACTACTTGATGAGGTGGAGGAATTGCGTAAGCAAACGCGCTCCATTTCGTTGTTAAGCGATCATTAAAAAACATTTGAAAAACACACCGCACTTTGAAAGTCTGAAAGTGCGGTCGTTTTTCTATGCGTTTTTACACGGCAAATGGGTCTTGTAGAATCATGGTTTGTACGCGATCCGGTCCGGTGGAAAGAATGGCTACCGGTACGCCGGTGACTTCTTCGATGCGTTTGATGTAGTCGCGGCAGGTTTGCGGCAATTGGTTAACATCGGTGATGCCGAAGGTGTTTTCTTTCCAGCCCGGCAAGGTTTCGTAAATCGGTTCAACGCCTTCCCAATCTTTCGCGGCGAGCGGGGCGTATTCCACGATGTCACCGTTCGGCATTTTGTAGCCGACG > 1/858138‑858628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |