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aTCGTTTGAGTCAAATATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCt < 1:753461/251‑1 (MQ=255) aGTCAAATATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTg < 1:507757/62‑1 (MQ=255) cAAATATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGt < 1:35366/98‑1 (MQ=255) aaaTATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGc > 1:846887/1‑41 (MQ=255) aaaTATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTgcgc < 1:284090/244‑1 (MQ=255) aaTATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAAttc > 1:418005/1‑112 (MQ=255) tatGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGAt < 1:19088/251‑1 (MQ=255) atGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCATAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGATg > 1:436400/1‑251 (MQ=255) aTTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGATGACTaa > 1:89857/1‑251 (MQ=255) cGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGATGACTAAAGAGCAATCGGCGAc > 1:811461/1‑250 (MQ=255) cGATTAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGATGACTAAAGAGCAATCGGCGAc < 1:376119/250‑1 (MQ=255) tAATTGTACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTAc > 1:558905/1‑221 (MQ=255) | ATACCAAGCAGAATGTTTAATTCTGTTTTTTCTATCCCTGCACGGTTGTATAAACGTCTTAGCCTTTGCATAACGCCCTGATTCTGAATGAACCCAACAGAACGATAAAGCTGCTCCGTATGGCTAAAAAAATATTCTAATTCCTCCATCTGCGGGTAAATATTCGCGTTATTGCGGATATTTTGGGAAGGTGATGCAATCGTTTGAGTCAAATATGCCATTCTGACTTCATAAGCGATTAATTGCACCGCCATGGCAAGATTAAGTGAGGTATAATCGGGATTAGCGGGAATAGTCACATGATAGTGGCATTTGAGTAATTCTTCATTAGTTAAGCCGACGCGTTCGCGCCCGAACACAATGGCGACTTTCCCGTTTGTTGCGTAAGCAACGGCTTTTTTGCCGCACTCACGCGGTTCAATAAGCGAATTCTGCAAATGGCGCAATCTTGCGCTGGTACCGATGACTAAAGAGCAATCGGCGAC > 1/841682‑842166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |