| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 833,699 | T→C | intergenic (+16501/+36329) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 833,699 | 0 | T | C | 98.6% | 217.6 / NA | 72 | intergenic (+16501/+36329) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (43/28); minor base A (1/0); total (44/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTTCAATGCGTAAGGTGTCGCCGCCTTTTTCAACTTTCTTTAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTGTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACTATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCAACGAATGCGCGGCAATGAAATTCACTTTGTTTGTGCCGA > 1/833458‑833941 | tttCAATGCGTAAGGTGTCGCCGCCTTTTTCAACTTTCTTTAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTaaa > 1:483499/1‑251 (MQ=255) gtgtCGCCGCCTTTTTCAACTTTCTTTAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATAc < 1:654464/250‑1 (MQ=255) tgtCGCCGCCTTTTTCAACTTTCTTTAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATAccc < 1:490552/251‑1 (MQ=255) ttctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTC‑TTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:133457/1‑240 (MQ=255) tctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:152161/1‑240 (MQ=255) tctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAgcg > 1:757903/1‑250 (MQ=255) tctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAgcg > 1:298129/1‑250 (MQ=255) ctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACAt < 1:891551/244‑1 (MQ=255) ctttAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAgcgc > 1:216137/1‑250 (MQ=255) gTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTa < 1:455810/205‑1 (MQ=255) gTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAAttttt > 1:212126/1‑251 (MQ=255) aaaTGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGtttt > 1:301467/1‑251 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCTCTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAATCTAGAAAAAATTCCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAAttt < 1:901656/221‑1 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:70226/1‑204 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:531178/1‑204 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAgcgc < 1:240499/215‑1 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGtt > 1:707517/1‑251 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGtt > 1:436449/1‑251 (MQ=255) gggtagggtaTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGtt > 1:233/1‑251 (MQ=255) ggtagggtATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAgg < 1:346113/248‑1 (MQ=255) gtagggtATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACt < 1:122242/179‑1 (MQ=255) agggtATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACAt < 1:555932/205‑1 (MQ=255) gggtATTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAgg < 1:190886/244‑1 (MQ=255) ggtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:71614/5‑198 (MQ=255) ggtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAata < 1:167389/245‑1 (MQ=255) ggtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACAATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGAAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAAtatt > 1:241228/5‑251 (MQ=255) gtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAgg < 1:50603/239‑1 (MQ=255) gtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat > 1:813823/4‑249 (MQ=255) gtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat > 1:413131/4‑249 (MQ=255) gtattGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAAtatta > 1:85849/4‑251 (MQ=255) attGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGAtt < 1:601753/166‑1 (MQ=255) ttGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt > 1:408080/1‑251 (MQ=255) ttGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt < 1:396675/251‑1 (MQ=255) gTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGaata > 1:791384/1‑251 (MQ=255) gAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATaaa > 1:742938/1‑250 (MQ=255) tAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATa > 1:678480/1‑185 (MQ=255) ccGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTaaaa > 1:288141/1‑251 (MQ=255) aaCAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATc < 1:481852/250‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGt > 1:888593/1‑161 (MQ=255) ttgttgTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat < 1:735386/210‑1 (MQ=255) ttgttgTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGtgc > 1:490530/1‑249 (MQ=255) aaaTTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGc > 1:655593/1‑248 (MQ=255) aaaTAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat > 1:96162/1‑186 (MQ=255) aTAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCAt < 1:251917/251‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCAttt < 1:464097/251‑1 (MQ=255) tCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAggg < 1:757716/251‑1 (MQ=255) ccATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAATTTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt < 1:886317/180‑1 (MQ=255) ccATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt > 1:822752/1‑180 (MQ=255) ccATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCat > 1:682489/1‑251 (MQ=255) aaTGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATc > 1:395104/1‑235 (MQ=255) aTGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATg > 1:855469/1‑249 (MQ=255) ccTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATg < 1:709787/242‑1 (MQ=255) ttCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGtgccttgcct < 1:855226/206‑1 (MQ=255) ttCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAggg > 1:697731/1‑233 (MQ=255) ttCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATAtt > 1:24614/1‑251 (MQ=255) aaTTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAgg > 1:209999/1‑140 (MQ=255) gTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTg > 1:518349/1‑251 (MQ=255) atatTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACg < 1:53998/117‑1 (MQ=255) atatTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat < 1:751806/135‑1 (MQ=255) atatTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGtgc > 1:19970/1‑174 (MQ=255) atatTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTggg < 1:756573/242‑1 (MQ=255) atTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCaa > 1:308429/1‑251 (MQ=255) cTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTc < 1:779014/216‑1 (MQ=255) gCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGatat < 1:61842/221‑1 (MQ=255) gCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCAACGAATGCGCGGCaa > 1:811548/1‑251 (MQ=255) ccTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGAc > 1:549217/1‑151 (MQ=255) ccTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCAACGAATGCGCGGCAAt > 1:435591/1‑251 (MQ=255) tATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt > 1:18841/1‑119 (MQ=255) cTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAatat > 1:554526/1‑111 (MQ=255) gttaagttaaAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGt < 1:364198/114‑1 (MQ=255) gttaagttaaAAATGTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGc > 1:648645/1‑160 (MQ=255) gTCTAAACCATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCAACGAATGCGCGGCAATGAAATTCACTTTGTTTGTGCCGa > 1:798412/1‑251 (MQ=255) | TTTCAATGCGTAAGGTGTCGCCGCCTTTTTCAACTTTCTTTAAGGTATTGAGGGAAATGAGATCTTTTTGCAGGGTAGGGTGTTGAAAGTCTTTGAATAACCGAACAATCCGTTTCTTTTGTTGTTCCGTTAAATTTTCTGAAAATAACGTCGCCATAATGTCGTCCTTTCTAATGTAGCAAATTAGTTCGCTATATTTAATCACTCCCGCCTTTATCTGTTAAGTTAAAAATGTCTAAACTATGATTAAACTAGAAAAAATACCCTCAATAAGGTAACATAAGCGCCAATTTTTTCCCTGTTTTTCACGAATTCTTAAGGTTAATATTATGTCGAATAATAAACGTAAAATCCTCGTGACTTGTGCCTTGCCTTATGCCAATGGTCCGATCCATTTAGGGCATATGCTGGAACATATTCAAGCGGATATTTGGGTGCGTTTTCAACGAATGCGCGGCAATGAAATTCACTTTGTTTGTGCCGA > 1/833458‑833941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |