| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 786,698 | A→G | intergenic (‑63984/‑493) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 786,698 | 0 | A | G | 100.0% | 208.1 / NA | 73 | intergenic (‑63984/‑493) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (43/30); total (43/30) | |||||||||||
GCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAA‑AAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTATTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCATCTTTCGGTGGTGGCGCG > 1/786454‑786938 | gCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGttttt > 1:481962/1‑251 (MQ=255) 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cacaTTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTg > 1:816035/1‑251 (MQ=255) aaTCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAAc < 1:419229/250‑1 (MQ=255) aaTCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAAc < 1:269863/250‑1 (MQ=255) 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aaGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTCATcc < 1:738486/251‑1 (MQ=255) aTCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCat > 1:340763/1‑205 (MQ=255) cGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTacaaca < 1:369392/251‑1 (MQ=255) 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cGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAgg < 1:371618/251‑1 (MQ=255) aaGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCa > 1:234769/1‑251 (MQ=255) gAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTa > 1:565309/1‑175 (MQ=255) cGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCAt > 1:295436/1‑251 (MQ=255) gAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGat < 1:526602/93‑1 (MQ=255) gTGCGGTGGTTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCATCTTTCgg > 1:572259/1‑251 (MQ=255) ggtTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTac > 1:405388/1‑207 (MQ=255) gtTTTTAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCATCTTTCGGTGGTGgcg > 1:657547/1‑251 (MQ=255) ttttAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGagaag < 1:856841/132‑1 (MQ=255) ttttAGCGGTGTTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCATCTTTCGGTGGTGGcgcg > 1:231432/1‑251 (MQ=255) | GCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAA‑AAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACGGGAACGGAAAAGTGCGGTGGTTTTTAGCGGTATTTTTTCTGATCGAATTTGCGCTAAACCGCCTAAAAATGCACAAAATGACTTGCGAAACGACAAGATATCCGTTAGTATCTGCGCCGTTATTTTTCATTAAAATTTGCTAAATCAGAGAAGATAAAATGTACTCAGCTTTGTTAATCATTTATTTGGTCGTTTCCATTGCCCTTATCGCGTTTATCCTGTTACAACAAGGTAAAGGCGCAGATGCAGGCGCATCTTTCGGTGGTGGCGCG > 1/786454‑786938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |