| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 771,525 | T→C | intergenic (‑48811/‑15666) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 771,525 | 0 | T | C | 100.0% | 139.3 / NA | 46 | intergenic (‑48811/‑15666) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (21/25); total (21/25) | |||||||||||
CGCTTTGAAACAGCTTCACCTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCTTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTACAAATCCGGATTTTCTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTCACGATGAATTTAAAATATCCGCAAAATCCACCGCACTTCAACCTATTTAACGGCTAAAACTGCTATAATTCCGCCAATTT > 1/771292‑771769 | cgcTTTGAAACAGCTTCACCTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATACCGCGTGGGGTTTTTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGt < 1:676465/249‑1 (MQ=255) cTTCCCCTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTaa < 1:67306/251‑1 (MQ=255) cTTCACCTTTAGCCAGGAGCCCCCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTaa < 1:497766/251‑1 (MQ=255) ttCACCTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAAt < 1:26043/251‑1 (MQ=255) ccTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGAtt > 1:185932/1‑251 (MQ=255) ccTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGAtt > 1:669707/1‑251 (MQ=255) aCCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGa < 1:543981/251‑1 (MQ=255) 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ccACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTa > 1:221619/1‑251 (MQ=255) cacaGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTAc < 1:496577/251‑1 (MQ=255) ggCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGatat < 1:844967/183‑1 (MQ=255) ggCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAata > 1:729501/1‑242 (MQ=255) aCTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTAtttt < 1:579961/157‑1 (MQ=255) tACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTACAAATCCGGATTTTCTTAAAAGt > 1:381351/1‑251 (MQ=255) gggCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTc > 1:808956/1‑154 (MQ=255) 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tttGGGAATCATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTACAAATCCGGATTTTCTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTCACGATGAATTTAAAATATCCGCAAAATCCACCGCACTTCAACCTATTTAACGGCTAAAACTGCTATAATTc < 1:510333/251‑1 (MQ=255) cATAGCCTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTACAAATCCGGATTTTCTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTCACGATGAATTTAAAATATCCGCAAAATCCACCGCACTTCAACCTATTTAACGGCTAAAACTGCTATAATTCCGCCAAttt < 1:200697/251‑1 (MQ=255) | CGCTTTGAAACAGCTTCACCTTTAGCCAGGAGCCACCCGATCACTTCATGCCCGATAACGCGTGGGGTTTGTAAGTTATGTTTGATATCGCCCAAATCTGCCCCGCACACGCCACAGGCTTCTACTTGAATCAATACTTGATGAGCGGTGGGCAATACGGTTTGCTTTTCGGTTAGTACTAAATCTCCTTGTGGCGTGGTTTGCATAGCTAAATAAGTTTTGGGAATCATAGCTTTTCCTCGTAAAAGTGAGTAAGTTTTTTAATGATTAAGTTTATTTTAAGGATAAAAAGTTGATATTTTCAATAGGTTTAAAATTAATGTAAAAATTCCCCTTACCTATTTCGCTTTATTTAATATGTACAAATCCGGATTTTCTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTCACGATGAATTTAAAATATCCGCAAAATCCACCGCACTTCAACCTATTTAACGGCTAAAACTGCTATAATTCCGCCAATTT > 1/771292‑771769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |