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(MQ=255) cTATAGGAGATGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAAt > 1:316350/1‑210 (MQ=255) cTATAGGAGATGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAATTCACCGCCAATCAgtgt > 1:573490/1‑227 (MQ=255) cTATAGGAGATGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAATTCACCGCCAATCAGTGTGATGCAGGGAAAGCCTCTTTCGTa > 1:316560/1‑251 (MQ=255) 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aTGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAATTCACCGCCAATCAGTGTGATGCAGGGAAAGCCTCTTTCGTACTGGGAt < 1:165695/249‑1 (MQ=255) aTGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAATTCACCGCCAATCAGTGTGATGCAGGGAAAGCCTCTTTCGTACTGGGATTa > 1:273045/1‑251 (MQ=255) aTGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTATGGTGCCGCCAATTGGCATGGCAATCGCTACTTGGTTAGCACGTAATAAATTCACCGCCAATCAGTGTGATGCAGGGAAAGCCTCTTTCGTACTGGGATTa > 1:635586/1‑251 (MQ=255) tGTAAATGCCATCGTGCTCGGGGTAATTATCGGCAGCATGATATGTATTGATATGGGCGGTCCGGTAAACAAAGCGGCTTACACCTTCTCGGTAGGTCTGTTGGCGTCACAGATTCACACTCCGATGGCCGCCGCCATGGCTGCCGGTAt > 1:86156/1‑150 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |