| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 618 | A→G | intergenic (–/+1812) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 618 | 0 | A | G | 100.0% | 145.1 / NA | 49 | intergenic (–/+1812) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (23/26); total (23/26) | |||||||||||
TAAAAACGTTCAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAACCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAAATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACGG > 1/384‑861 | tAAAAACGTTTAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTa < 1:386965/251‑1 (MQ=255) 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aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:861604/250‑1 (MQ=25) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:154325/250‑1 (MQ=25) | TAAAAACGTTCAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAACCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAAATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACGG > 1/384‑861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |