| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 722,755 | C→T | intergenic (‑41/‑64436) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 722,755 | 0 | C | T | 100.0% | 171.6 / NA | 57 | intergenic (‑41/‑64436) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (23/34); total (23/34) | |||||||||||
AACTAAAATGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACCAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCGATTATAGGGAAATATCGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCATTTTTTTGATCGTATGTAGGGTAAAAGAAAACCGTCTTTTTGAGTAAAAGACGGTTTTAATTTTATTATTTACATACTTTATTGG > 1/722525‑722990 | aactaaaaTGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAat < 1:289762/248‑1 (MQ=255) 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atatTGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCATTTTTTTGATCGTATGTAGGGTAAAAGAAAACCGTCTTTTTGAGTAAAAGACGGTTTTAAt > 1:175484/1‑216 (MQ=255) | AACTAAAATGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACCAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCGATTATAGGGAAATATCGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCATTTTTTTGATCGTATGTAGGGTAAAAGAAAACCGTCTTTTTGAGTAAAAGACGGTTTTAATTTTATTATTTACATACTTTATTGG > 1/722525‑722990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |