| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 703,376 | G→A | intergenic (‑9635/+19262) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Thr‑TGT/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 703,376 | 0 | G | A | 99.2% | 350.6 / NA | 118 | intergenic (‑9635/+19262) | unknown/unknown | tRNA‑Thr‑TGT/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (53/64); total (53/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GCGCGAAGATTACCGCTTAATGAAAAACGCCACTTTTACCTCCTGTTTGCCGAATGATAATGCCTGGTCTATTTACGCCAGCGAAATGCGCCAACATGTGAAAGAAGAATATGCGGAAATGTGGCACGCCCGTTTTCGCGTGCATGGTGTACCGGTGTTCTACACACCGTATTTCCAACTGCCTATCGGCGATCGCCGTCGTTCCGGTTTGTTGGTACCTACTGCCGGACATTCCAGCCGCGGCGGTTATTTCTATGCACAACCGGTGTATTGGAACATCGCGCCGAATTACGACGCTACCATTGCGCCGAAATATATGTCAAAACGGGGTTGGCAGTTCAACGGCGAATTTCGTTATTTAACACCACTCGGTGAAGGGAAAATTGCCGGTGAATATTTAGGCAATGATCGATTAACGGATTACACGGCAGAAAATCGCAAACGCCATTTATTGCACTGGTTACACAGTTCCAGCT > 1/703134‑703609 | gcgcGAAGATTACCGCTTAATGAAAAACGCCACTTTTACCTCCTGTTTGCCGAATGATAATGCCTGGTCTATTTACGCCAGCGAAATGCGCCAACATGTGAAAGAAGAATATGCGGAAATGTGGCACGCCCGTTTTCGCGTGCATGGTGTACCGGTGTTCTACACACCGTATTTCCAACTGCCTATCGGCGATCGCCGTCGTTCCGGTTTGTTGGTACCTACCGCCGGACATTCCAGCCGCGACGGTTAtt > 1:514565/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |