| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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CACAATGCCCACTTCATGCAAACGCGCTGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGATTGTTCCTGATG > 1/662969‑663447 | cacaATGCCCACTTCATGCAAACGCGCCGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCCAGTGCCGTACGTTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGGCTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAAt < 1:381873/251‑1 (MQ=255) 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< 1:287754/162‑1 (MQ=255) gAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAGTCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCg > 1:899628/1‑251 (MQ=255) ta‑‑‑tTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGata < 1:868030/251‑1 (MQ=255) gAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAAtt > 1:543349/1‑251 (MQ=255) ttGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGAt < 1:837943/251‑1 (MQ=255) gCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATg > 1:100641/1‑250 (MQ=255) cTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAAt < 1:765884/240‑1 (MQ=255) cTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGc < 1:787540/250‑1 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAggg < 1:236525/123‑1 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGtt > 1:560462/1‑125 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGAt > 1:301769/1‑206 (MQ=255) 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aCATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGAtt < 1:240233/251‑1 (MQ=255) ttACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAAtgt > 1:285415/1‑152 (MQ=255) ttACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGAtt < 1:164803/248‑1 (MQ=255) ttCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGATTGTTCCtgatg < 1:883546/251‑1 (MQ=255) gcgcAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAg < 1:860865/149‑1 (MQ=255) gcgcAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGc < 1:784527/191‑1 (MQ=255) | CACAATGCCCACTTCATGCAAACGCGCTGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGATTGTTCCTGATG > 1/662969‑663447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |