| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 629,353 | C→T | intergenic (+19179/+64004) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 629,353 | 0 | C | T | 100.0% | 170.5 / NA | 60 | intergenic (+19179/+64004) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (25/35); total (25/35) | |||||||||||
GTTGGCACGAGCTTATAGAAAAACGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATCGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTATCGC > 1/629109‑629598 | gTTGGCACGAGCTTATAGAAAAACGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAg < 1:809413/249‑1 (MQ=255) aGCTTATAGAAAAACGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGaa < 1:321018/246‑1 (MQ=255) aaCGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:695335/251‑1 (MQ=255) aCGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac > 1:453490/1‑250 (MQ=255) cccAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCt > 1:670668/1‑250 (MQ=255) aTAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAg < 1:545295/251‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGccc < 1:278996/251‑1 (MQ=255) aTGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGcc > 1:251741/1‑249 (MQ=255) tGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCAt > 1:779097/1‑251 (MQ=255) cccGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATAc < 1:170047/251‑1 (MQ=255) ccGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATAcc < 1:310409/251‑1 (MQ=255) gTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCgg > 1:680130/1‑251 (MQ=255) cacaGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATcc < 1:338843/250‑1 (MQ=255) ccaGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCcac < 1:100311/250‑1 (MQ=255) cgcgGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCcac < 1:131001/247‑1 (MQ=255) ggcgAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAac < 1:721344/206‑1 (MQ=255) taataCGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGc < 1:359387/251‑1 (MQ=255) ataCGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCaa > 1:417697/1‑251 (MQ=255) gcgcAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTACAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAAttttt > 1:264877/1‑251 (MQ=255) gcaCATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:512380/190‑1 (MQ=255) gcaCATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATg > 1:137062/1‑251 (MQ=255) cacaTAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATgg > 1:180100/1‑251 (MQ=255) gCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCgg > 1:820719/1‑212 (MQ=255) gTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCa > 1:392574/1‑251 (MQ=255) ggAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:106711/168‑1 (MQ=255) ggAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGAtt > 1:35986/1‑178 (MQ=255) aGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAAtt > 1:587689/1‑251 (MQ=255) ggTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAg < 1:895274/205‑1 (MQ=255) gTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGcc > 1:552492/1‑184 (MQ=255) gTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAg > 1:867516/1‑204 (MQ=255) gTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATgg > 1:194672/1‑225 (MQ=255) gTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTg > 1:284396/1‑250 (MQ=255) gTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAGTGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTg < 1:384947/133‑1 (MQ=255) gTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:181387/153‑1 (MQ=255) gTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGcc < 1:659333/174‑1 (MQ=255) cGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:264181/148‑1 (MQ=255) cGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCcac > 1:784530/1‑184 (MQ=255) cGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATAtt > 1:692348/1‑250 (MQ=255) cGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATAtt > 1:184295/1‑250 (MQ=255) ttAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAacac < 1:271243/145‑1 (MQ=255) cgcAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTc < 1:119382/151‑1 (MQ=255) cgcAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATg < 1:465159/251‑1 (MQ=255) tgGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCAtc < 1:125129/251‑1 (MQ=255) cAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCttcttc < 1:4738/250‑1 (MQ=255) cacaCGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAAt > 1:1832/1‑196 (MQ=255) cGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAAttt > 1:298526/1‑161 (MQ=255) gACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCg < 1:133917/179‑1 (MQ=255) gACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCcggcgg > 1:107049/1‑251 (MQ=255) cTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTAt < 1:206388/131‑1 (MQ=255) ggTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAAtt < 1:655280/146‑1 (MQ=255) aaaTCTTTTTCCCCGGTTAATCCCGCCG‑TTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAAtg < 1:276662/251‑1 (MQ=255) aaTCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAAtg < 1:106246/251‑1 (MQ=255) cTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGa > 1:624272/1‑251 (MQ=255) ggTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACGCCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTAt < 1:260696/107‑1 (MQ=255) ggTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAAtg < 1:574631/238‑1 (MQ=255) ggTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGAt > 1:807905/1‑251 (MQ=255) gTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGAt < 1:49978/250‑1 (MQ=255) ttAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATc < 1:764763/250‑1 (MQ=255) cAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAAtg < 1:586307/218‑1 (MQ=255) taattTTTGGAAAATATCAATATTGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTAcaaggac < 1:841309/251‑1 (MQ=255) atatcaatattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTg > 1:266711/1‑45 (MQ=255) tatcaatattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTa > 1:626178/1‑251 (MQ=255) atcaatattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTAt < 1:46323/251‑1 (MQ=255) atattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTAcaaggaccgcaa > 1:255256/1‑237 (MQ=255) atattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTATCGc > 1:708630/1‑250 (MQ=255) atattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTATCGc > 1:79612/1‑250 (MQ=255) atattGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTATCGc > 1:879940/1‑250 (MQ=255) | GTTGGCACGAGCTTATAGAAAAACGCTTCGGCGGCACCCAATAAATGCCCGTGACGCACAGCGCGGCGAATAATACGGCGCAGCACATAGCCACGTCCTTCGTTGGAAGGTACCACACCGTCTACGATTAAATAGGCGCAAGAACGAATGTGGTCGGCAATCACACGTAAAGACTTATTGGTTAAATCTTTTTCACCGGTTAATTCCGCCGTTTTAGCAATTAATTTTTGGAAAATATCAATATCGTAGTTGGAATTCACATGTTGCAACACCGCACTGATTCGCTCCAAGCCCATACCGGTATCCACAGAAGGCTTCGGCAATTTTTCCATGGTGCCATCGGCATGGCGATTAAATTGCATGAACACGATATTCCAGATTTCAATGTAACGATCGCCATCTTCTTCCGGCGATCCCGGCGGTCCGCCCCAAATGTGATCGCCATGATCGTAGAAAATTTCGGTACAAGGACCGCAAGGACCGGTATCGC > 1/629109‑629598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |