| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 620,640 | C→T | intergenic (+10466/+72717) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 620,640 | 0 | C | T | 100.0% | 254.7 / NA | 90 | intergenic (+10466/+72717) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (42/48); total (42/48) | |||||||||||
ACGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGCGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGCTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTGAGAAT > 1/620400‑620885 | aCGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTc < 1:59793/251‑1 (MQ=255) ccACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTgg > 1:532090/1‑250 (MQ=255) caAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGGTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTa > 1:771159/1‑251 (MQ=255) cTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCa > 1:458830/1‑251 (MQ=255) cTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAAATAGATACTGAGTTCTATTTTTTATTGTTTAGATCTCAATCTTTTTGAAATCGGTTTAAACCGGTTTTTGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGCGATTAAATAGCttaacca > 1:424373/1‑245 (MQ=255) ggACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCg > 1:260340/1‑251 (MQ=255) gtTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTa > 1:142606/1‑251 (MQ=255) ttttATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTaa < 1:265034/251‑1 (MQ=255) ttttATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTaa < 1:136986/251‑1 (MQ=255) aaaTTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTg > 1:163629/1‑226 (MQ=255) aTTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAAc < 1:170547/251‑1 (MQ=255) tggcATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGcac < 1:153110/249‑1 (MQ=255) atTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTGAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACagatagat > 1:90423/1‑251 (MQ=255) atTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACagatagat > 1:300821/1‑251 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATc < 1:290918/192‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGAtt > 1:732273/1‑251 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGAtt < 1:230746/251‑1 (MQ=255) tGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGAttt < 1:90229/251‑1 (MQ=255) aataaataCGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTg > 1:307205/1‑187 (MQ=255) aataaataCGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCaa > 1:129555/1‑250 (MQ=255) aTTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCt < 1:117059/251‑1 (MQ=255) gTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAAt > 1:844200/1‑146 (MQ=255) tGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTccacc < 1:697916/251‑1 (MQ=255) tGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTccacc < 1:669836/251‑1 (MQ=255) cccTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATc < 1:103579/145‑1 (MQ=255) ggATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTaa < 1:389663/156‑1 (MQ=255) aaaCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTccacccac < 1:115753/228‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATtcctc < 1:193832/165‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATtcc < 1:800725/163‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGcac < 1:239785/170‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTg > 1:41991/1‑185 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGt < 1:777417/203‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAg < 1:39005/213‑1 (MQ=255) aCTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTg > 1:14627/1‑248 (MQ=255) aGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCa > 1:832635/1‑251 (MQ=255) aTACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAg < 1:668193/197‑1 (MQ=255) aTACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTccacccac < 1:103756/221‑1 (MQ=255) gTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCATTCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTg < 1:699486/173‑1 (MQ=255) gTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAAc < 1:744923/145‑1 (MQ=255) gTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGTAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGct > 1:211312/1‑249 (MQ=255) gTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAAt < 1:134963/228‑1 (MQ=255) gTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACg > 1:363244/1‑247 (MQ=255) cTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTg < 1:567422/166‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTGAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACg < 1:69962/242‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGc < 1:598336/98‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATc < 1:313745/103‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATtcctc < 1:654898/148‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACagatagat > 1:237424/1‑161 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTAt < 1:665794/191‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAgtg < 1:71980/198‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAgtg > 1:777548/1‑198 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAgtg > 1:417674/1‑198 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAg < 1:292709/196‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCagaag < 1:795338/219‑1 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCagaag > 1:10831/1‑219 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTcttctt > 1:60313/1‑250 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTcttctt > 1:181742/1‑250 (MQ=255) aTTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTcttctt > 1:175734/1‑250 (MQ=255) atatTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCagaag < 1:555504/214‑1 (MQ=255) atatTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTg < 1:700083/251‑1 (MQ=255) atTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGa < 1:573658/82‑1 (MQ=255) gtgtAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTaa < 1:849684/115‑1 (MQ=255) gtgtAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTAt > 1:470846/1‑181 (MQ=255) gtgtAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTccacccac < 1:178862/199‑1 (MQ=255) gtgtAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTa > 1:66395/1‑250 (MQ=255) gtgtAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTa > 1:296024/1‑250 (MQ=255) gtgcaGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGcac > 1:560190/5‑143 (MQ=255) tAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACggg < 1:348493/251‑1 (MQ=255) tctcAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAGGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCata > 1:896864/1‑251 (MQ=255) cTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTc > 1:766770/1‑203 (MQ=255) ggTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAAc < 1:582201/176‑1 (MQ=255) ggTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTcc > 1:154996/1‑192 (MQ=255) tttAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCagag < 1:80345/251‑1 (MQ=255) gTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATc < 1:203525/57‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCGCCCACGGCGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGAc < 1:63808/251‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGAc < 1:751977/251‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGAc < 1:111258/251‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGAc < 1:730503/251‑1 (MQ=255) gTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGAttt > 1:508985/1‑107 (MQ=255) gTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCaa > 1:244635/1‑251 (MQ=255) gTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCaa > 1:44336/1‑251 (MQ=255) gTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCaa > 1:479200/1‑251 (MQ=255) tAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCt > 1:818786/1‑136 (MQ=255) atatACGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGat > 1:470664/1‑251 (MQ=255) tataCGAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCagaga > 1:426599/1‑230 (MQ=255) gAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCg > 1:112012/1‑188 (MQ=255) gAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTgag > 1:480388/1‑251 (MQ=255) gAAGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTgag > 1:33364/1‑251 (MQ=255) aaGTATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGGTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTgaga < 1:329822/251‑1 (MQ=255) tATGTTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGGGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTGAGAAt < 1:643368/250‑1 (MQ=255) | ACGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGCGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGCTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTGAGAAT > 1/620400‑620885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |