| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 617,630 | C→T | intergenic (+7456/+75727) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 617,630 | 0 | C | T | 100.0% | 259.4 / NA | 87 | intergenic (+7456/+75727) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/41); total (46/41) | |||||||||||
CCGGAAGATTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGCGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGTCTCAACGG > 1/617391‑617865 | ccGGAAGATTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCAt > 1:40264/1‑251 (MQ=255) aTTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAatat > 1:663992/1‑251 (MQ=255) aTTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAatat > 1:659809/1‑251 (MQ=255) aTTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAatat < 1:835062/251‑1 (MQ=255) tgtgAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAatat < 1:344497/249‑1 (MQ=255) tgAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCCTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTtgtgtg < 1:449766/232‑1 (MQ=255) gAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATcc < 1:796222/237‑1 (MQ=255) gAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAatat > 1:612513/1‑246 (MQ=255) aaTACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGaa < 1:649005/251‑1 (MQ=255) tactacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATc > 1:134516/1‑233 (MQ=255) tactacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATc < 1:508843/244‑1 (MQ=255) tactacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAg > 1:688594/1‑251 (MQ=255) tactacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAg > 1:416000/1‑251 (MQ=255) tactacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAg > 1:895317/1‑251 (MQ=255) ctacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGta > 1:757551/1‑251 (MQ=255) tacATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGtat < 1:483587/251‑1 (MQ=255) gtgCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGa > 1:448661/1‑251 (MQ=255) tgCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCAGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGa < 1:378028/250‑1 (MQ=255) tCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAaac < 1:330507/251‑1 (MQ=255) ccGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGa > 1:230747/1‑241 (MQ=255) gTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGAt > 1:643882/1‑211 (MQ=255) gatgaACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACCTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACct > 1:589377/1‑250 (MQ=255) gTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGAtt > 1:187104/1‑251 (MQ=255) aaTCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCg < 1:899735/239‑1 (MQ=255) aaTCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACCCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCg > 1:829394/1‑251 (MQ=255) gTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATc < 1:749220/186‑1 (MQ=255) tGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTtgctg > 1:883117/1‑249 (MQ=255) tGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGcc < 1:600647/251‑1 (MQ=255) aCCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCa < 1:711796/251‑1 (MQ=255) aCCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCa > 1:158900/1‑251 (MQ=255) ccTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGtt > 1:622422/1‑223 (MQ=255) ccTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCAt > 1:228609/1‑251 (MQ=255) gtgtTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCAc < 1:380167/231‑1 (MQ=255) gAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTtgc > 1:530602/1‑230 (MQ=255) aaGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATg < 1:96584/251‑1 (MQ=255) gATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGa > 1:170332/1‑190 (MQ=255) tatCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGAt > 1:498407/1‑240 (MQ=255) tGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCg > 1:719987/1‑251 (MQ=255) gTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGa > 1:54743/1‑251 (MQ=255) gatTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGt > 1:58553/1‑250 (MQ=255) ggcTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGAt < 1:472292/133‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTcac < 1:716138/237‑1 (MQ=255) gTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATc > 1:683170/1‑119 (MQ=255) gTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAgg > 1:620785/1‑133 (MQ=255) gTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACct < 1:565686/159‑1 (MQ=255) gTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAg > 1:805477/1‑250 (MQ=255) tttAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGc < 1:468229/250‑1 (MQ=255) tctAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGcc < 1:584384/249‑1 (MQ=255) tAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATc > 1:96160/1‑116 (MQ=255) tAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGc > 1:533627/1‑248 (MQ=255) cGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCaag < 1:346560/251‑2 (MQ=255) tAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGCGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGAt > 1:315142/1‑104 (MQ=255) tGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATg < 1:253133/247‑1 (MQ=255) tGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAAt > 1:238999/1‑251 (MQ=255) cACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGttt > 1:116214/1‑250 (MQ=255) cACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGttt > 1:831614/1‑250 (MQ=255) ttGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCacaaca > 1:497322/1‑202 (MQ=255) ttGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTc < 1:637784/251‑1 (MQ=255) gCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCAc > 1:753405/1‑166 (MQ=255) gTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCg < 1:639157/123‑1 (MQ=255) tGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTaa < 1:389551/249‑1 (MQ=255) cGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAAcc < 1:613347/251‑1 (MQ=255) gTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCa < 1:648978/250‑1 (MQ=255) aaaTTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATgggg < 1:835461/251‑1 (MQ=255) tACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAAc < 1:21266/251‑1 (MQ=255) cGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTAcc < 1:30991/251‑1 (MQ=255) tttttCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGcc < 1:296780/191‑1 (MQ=255) tttttCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACcac < 1:168048/251‑1 (MQ=255) tttttCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACcac < 1:709635/251‑1 (MQ=255) tttttCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACca > 1:170653/1‑250 (MQ=255) atTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAata < 1:192596/251‑1 (MQ=255) gATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAAc > 1:18813/1‑145 (MQ=255) gATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATAtt > 1:346097/1‑250 (MQ=255) aTTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACGACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTc < 1:331341/250‑1 (MQ=255) catcaCACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCa > 1:622323/1‑116 (MQ=255) catcaCACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGcc < 1:360261/176‑1 (MQ=255) cacGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACgg > 1:715507/1‑251 (MQ=255) cAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGa < 1:896720/250‑1 (MQ=255) aaCCAATTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGAc < 1:106411/215‑1 (MQ=255) aCCAATTTAAGCCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGtc < 1:759696/251‑1 (MQ=255) aaTTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAAcc > 1:340996/1‑127 (MQ=255) aaTTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCacaaca < 1:889542/142‑1 (MQ=255) aaTTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGa > 1:305092/1‑210 (MQ=255) aaTTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGTCTCa > 1:40909/1‑251 (MQ=255) aaTTTAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCC‑TGGCAGCAGAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGTCTCaa > 1:447252/1‑251 (MQ=255) tAAACCGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGTCTCAACgg < 1:455622/251‑1 (MQ=255) ccGTTGGTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGgc > 1:611468/1‑158 (MQ=255) ggTTTGTGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATgggg < 1:830848/196‑1 (MQ=255) | CCGGAAGATTGTGAATACTACATGTGCGGACCTCCGGTGATGAACGCTGCGGTAATCAAAATGTTGAAAGACCTTGGTGTTGAAGATGAAAATATCTTGTTAGATGATTTCGGCGGCTAACGCCTTGCAGTTTAAAAACACCGTAAAAAATGACCGCACTTTGCATGAAGTGCGGTCGAAATTTACAGCGTTTTTCATATTGATTCATCACACGCAAACCAATTTAAACCGTTGGTTTGCGTGTGATCCATCTAATATCAGGAAAGTATTATGAACATAAAACAACCTCTCGTTCGCGGATTCGCACTTGCTGCCATGGCATTGGCACTGATGGCCTGCGATAAACCGAATCCGTCACAACAAGCGGACACACAACAAGCCATGGCAGCAAAAAATGAAATTGTTTCCCTCACCGGTAAAACCATGGGGACAACCTACCACATCAAATATTCAAACAACGGCGAAGTCTCAACGG > 1/617391‑617865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |