| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 567,550 | T→C | intergenic (+204133/‑4469) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 567,550 | 0 | T | C | 100.0% | 192.9 / NA | 66 | intergenic (+204133/‑4469) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (39/27); total (39/27) | |||||||||||
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ttCTTTAATCATGGAATCCAAAAACGGGTGTGCTTTGCCTTCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGaa > 1:781987/1‑210 (MQ=255) tCTTTAATCATGGAATCCAAAAACGGGTGTGCTTTGCCTTCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGAATTCGCGCCCGTATTCCCAAGCGGAAGTGGTGTTGAAGACCGt < 1:518307/251‑1 (MQ=255) cATGGAATCCAAAAACGGGTGTGCTTTGCCTTCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGAATTCGCGCCCGTATTCCCAAGCGGAAGTGGTGTTGAAGACCGTTGCCAAtt < 1:678354/251‑1 (MQ=255) tgctttgcctTCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGAATTCGCGCCCGTATTCCCAAGCGGAAGTGGTGTTGAAGACCGTTGCCAATTTGTTCACCAATACGGTTTTa > 1:455131/1‑250 (MQ=255) gctttgccttCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGAATTCGCGCCCGTATTCCCAAGCGGAAGTGGTGTTGAAGACCGTTGCCAATTTGTTCACCAATACGGTTTTAc > 1:895860/1‑250 (MQ=255) | TTTTTTCCACAATTTCTTTTACCCGATTATAGCGCTCCAAATAACTTGGCGATTCAATTTCAATGTATGGGACATTGTATTTATCTAACAATTTTTTGAGTAACTGTTGGAAACGTTGTCGCTGTTTTTGATTGCCCAGGCTACGCAAACCGTCATCAACCCATTGCGTGTTATTGTTTAACAAAATGGTGACATCAAAAGGATATTCTTTAATCATGGAATCCAAAAACGGGTGTGCTTTGCTTTCGTATTGAATACAAAATGCCTGTGTGGTGATGAAATCCGTATCAATAATGGCGACTTTGTGGGCGTGTCGCACAGCATAATCGATGTAACGTTGATGTCCTAACGCCATTTGAGGATAATCGGAATATTGCATGGCCTGTTCGTCACCGCCCAGTTTTTCAAATACGAATTCGCGCCCGTATTCCCAAGCGGAAGTGGTGTTGAAGACCGTTGCCAATTTGTTCACCAATACGGTTTTAC > 1/567307‑567792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |