| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 566,809 | 0 | C | T | 100.0% | 229.1 / NA | 79 | intergenic (+203392/‑5210) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/33); total (46/33) | |||||||||||
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gggTGTGGTTTCGGCGCTTCATGGCAAATTAAAATATCGGCTTGTTGTTGCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCa > 1:375080/1‑143 (MQ=255) ggTGTGGTTTCGGCGCTTCATGGCAAATTAAAATATCGGCTTGTTGTTGCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTGTCCGCGAAATACCCCGCCCAAACCGGCAATTCTTTTATTCTGAATttgttg > 1:455188/1‑244 (MQ=255) ggTGTGGTTTCGGCGCTTCATGGCAAATTAAAATATCGGCTTGTTGTTGCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTGTCCGCGAAATACCCCGCCCAAACCGGCAATTCTTTTATTCTGAATTTGTTGCACGCGt > 1:1615/1‑251 (MQ=255) ggTTTCGGCGCTTCATGGCAAATTAAAATATCGGCTTGTTGTTGCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTg > 1:214709/1‑188 (MQ=255) 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ttgttgCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTGTCCGCGAAATACCCCGCCCAAACCGGCAATTCTTTTATTCTGAATTTGTTGCACGCGTCCATGTAAATTGCGCGTTTTCCATTCTGTCCCCCAAATGGAc < 1:683894/250‑1 (MQ=255) tgCTCGAAAATTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTGTCCGCGAAATACCCCGCCCAAACCGGCAATTCTTTTATTCTGAATTTGTTGCACGCGTCCATGTAAATTGCGCGTTTTCCATTCTGTCCCCCAAATGGACTCaaa < 1:840213/251‑1 (MQ=255) aTTTCAATATTGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTggcgg < 1:549082/125‑1 (MQ=255) | ATATAAAGATAATTTCCCGCTTCATCACATAAGCTACGAAATCCCACGTTGATAATTTGGTAATTCTGTTGAGGTAAGGTGCGGTAATCAAAATTTTCGTGGTGATGTCCATGATAGATTTGTGTTACACCTAATTTTTTTGCCAGTTGATTGATCACATCAAAGCCGGAAGGGTGTGGTTTCGGCGCTTCATGGCAAATTAAAATATCGGCTTGTTGTTGCTCGAAAATTTCAATATCGGAAGGAAAGATCGACGTGCGGTGACGCAAAGGCACTCCGCCACGCCAGATTTTTTCCTGTGGGCAATATTGGCAATAGTGGATCGGATCAAAAAATAACGGCTTATTTGGCGGCATCCAGATTTGTCCGCGAAATACCCCGCCCAAACCGGCAATTCTTTTATTCTGAATTTGTTGCACGCGTCCATGTAAATTGCGCGTTTTCCATTCTGTCCCCCAAATGGACTCAAA > 1/566571‑567040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |