| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 555,370 | C→T | intergenic (+191953/‑16649) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 555,370 | 0 | C | T | 100.0% | 182.0 / NA | 71 | intergenic (+191953/‑16649) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (33/38); total (33/38) | |||||||||||
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tATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCAccc < 1:604799/251‑1 (MQ=255) tATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCAccc < 1:60690/251‑1 (MQ=255) cACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTCTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATcc < 1:442594/251‑1 (MQ=255) cACGGTTGTTGGTATTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGAGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATcc < 1:592589/251‑1 (MQ=255) gttgttGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTc > 1:114875/1‑100 (MQ=255) ttgttgGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTAt < 1:596947/251‑1 (MQ=255) tgGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTATGGGt < 1:110779/251‑1 (MQ=255) ttCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTATGGGTAGGtt < 1:656965/251‑1 (MQ=255) ttCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTATGGGTAGGtt < 1:637833/251‑1 (MQ=255) ttCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTATGGGTAGGtt < 1:822286/251‑1 (MQ=255) | TGAAAGGCACGCAAACCTAAAATACAACTATGGTAACCGACATTTTTGGTCGAAAGGCTATTATGTAAGCACGGTAGGGCTAAATACAAAGACAGTGGAGGAGTATATAAGGAATCAGGAAAAGGAAGACATGATTCAGGATAATTTATCGAAGAAAGAATATGTGGACCCCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCACATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGCCCTTATAGGGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGTTATTTTTCTTGATTCACAGCTAAAAAACATCTGGAAATTCGACCGCACTTTTTGTTGTTTACGTCTCAAATTCATTCTTTTCATGAAAGCGTATAAGTTATTTAAAAGCTTATTGCTTTCGTTATGTTTTTTGTGCTAGAATCCGCACCCTATCCATTATGGGTAGGTT > 1/555153‑555616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |