| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 552,295 | C→T | intergenic (+188878/‑19724) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 552,295 | 0 | C | T | 100.0% | 237.9 / NA | 83 | intergenic (+188878/‑19724) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/45); total (38/45) | |||||||||||
GAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGCGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCACCAAATATAAGGTGGCTAAAAACAG > 1/552048‑552541 | gAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGt > 1:84090/1‑251 (MQ=255) 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1:36188/1‑251 (MQ=255) gaTCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCaa > 1:381374/1‑251 (MQ=255) gaTCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCaa > 1:303442/1‑251 (MQ=255) ctcAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACcaccaataacaccaataa > 1:460888/1‑57 (MQ=255) ctcAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCa > 1:421334/1‑251 (MQ=255) 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GAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGCGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCACCAAATATAAGGTGGCTAAAAACAG > 1/552048‑552541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |