| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 432,788 | T→C | intergenic (+69371/‑139231) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 432,788 | 0 | T | C | 100.0% | 267.7 / NA | 91 | intergenic (+69371/‑139231) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (42/49); total (42/49) | |||||||||||
TTAAAACGCGCCTGAAAACGCCGCACCGTTTGTGGCGTTAAACTGATTTCCGGCACCAACACCAGCACTTGCTTGCCTTGCTGCAAAATCTCTTCGATAAATTGCAAATAGATTTCCGTTTTGCCGGAACCCGTCACGCCGTCCAACAACCACGGGACAAAACCCTGAGTAAATTTCAACTGACTGAACACTAACGCCTGCGACTTGTTTAAGGTTAAACGATCCGCCTTATTCACAAGCGGCTTATTGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAGGGTTGTTGCCTTTCTCCGGCAAATCATTCGCCGCCTGCAACGCTTCAAGCTGCTTCTTCGCGCGTTTCAATAAGCCCTGCGCCAATGCCTGCTCACCAAGTGCGGTCGGTTTCCAAAAAACACTTGGGTTTTCCAC > 1/432541‑433022 | ttAAAACGCGCCTGAAAACGCCGCACCGTTTGTGGCGTTAAACTGATTTCCGGCACCAACACCAGCACTTGCTTGCCTTGCTGCAAAATCTCTTCGATAAATTGCAAATAGATTTCCGTTTTGCCGGAACCCGTCACGCCGTCCAACAACCACGGGACAAAACCCTGAGTAAATTTCAACTGACTGAACACTAACGCCTGCGACTTGTTTAAGGTTAAACGATCCGCCTTATTCACAAGCGGCTTATCGcc < 1:901774/251‑1 (MQ=255) 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1:710148/1‑209 (MQ=255) gATCCGCCTTATTCACAAGCGGCTTATCGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAGGGTTGTTGCCTTTCTCCGGCAAATCATTCGCCGCCTGCAACGCTTCAAGCTGCTTCTTCGCGCGTTTCAATAAGCCCTGCGcc > 1:196121/1‑209 (MQ=255) gCCTTATTCACAAGCGGCTTATCGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAggg < 1:668951/123‑1 (MQ=255) gCCTTATTCACAAGCGGCTTATCGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAGGGTTGTTGCCTTTCTCCGGCAAATCATTCGCCGCCTGCAACGCTTCAAGCTGCTTCTTCGCGCGTTTCAATAAGCCCTGCGCCAATGCCTGCTCACCAAGTGCGGTCGGTTTCCAAAAAACACTTGGGtt > 1:502516/1‑251 (MQ=255) gCCTTATTCACAAGCGGCTTATCGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAGGGTTGTTGCCTTTCTCCGGCAAATCATTCGCCGCCTGCAACGCTTCAAGCTGCTTCTTCGCGCGTTTCAATAAGCCCTGCGCCAATGCCTGCTCACCAAGTGCGGTCGGTTTCCAAAAAACACTTGGGtt > 1:134437/1‑251 (MQ=255) 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TTAAAACGCGCCTGAAAACGCCGCACCGTTTGTGGCGTTAAACTGATTTCCGGCACCAACACCAGCACTTGCTTGCCTTGCTGCAAAATCTCTTCGATAAATTGCAAATAGATTTCCGTTTTGCCGGAACCCGTCACGCCGTCCAACAACCACGGGACAAAACCCTGAGTAAATTTCAACTGACTGAACACTAACGCCTGCGACTTGTTTAAGGTTAAACGATCCGCCTTATTCACAAGCGGCTTATTGCCTAATTGTTGCTGCCAGGTTTGGATTTCCGTTTCCAGAGCAACTTCCGTGACGTAATCTTTGGCTTTCAGCGCCGACCAAATCGCCGCACTAAAAGGGTTGTTGCCTTTCTCCGGCAAATCATTCGCCGCCTGCAACGCTTCAAGCTGCTTCTTCGCGCGTTTCAATAAGCCCTGCGCCAATGCCTGCTCACCAAGTGCGGTCGGTTTCCAAAAAACACTTGGGTTTTCCAC > 1/432541‑433022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |