| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 419,693 | T→C | intergenic (+56276/‑152326) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 419,693 | 0 | T | C | 100.0% | 242.5 / NA | 81 | intergenic (+56276/‑152326) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (43/38); total (43/38) | |||||||||||
CAATTTTGCCGTCTGGAAATTCAAACGGGTCATGGTTGCTGGAACTGAACACCAGACTGAAGAACGGCTTGCCTTCTTTTTGTAATTGGGTGAAGGTCTCGTTGGCTTTGGTGAACAGGTCTTCGTCGCTCACGCCCCAGGTGCCGGTAAAGGTCGGATTTTGATAATCCATTTGGTCGATAATGCGTTTGAAGCCGTTGCCGTAGAAAAAGCCCGCCATGTTGTCGAAGTGTTTTTCTCCGCCGTAAATAAAGGAAGTGTCATAGCCCCGTTGGCTTAATAATTGCGCTAAGGTGAAAAAGCCGTTTTGGCTGTTATTCAGTTTCACCACGGCGCGCGCCGGTGTTGGCGTGAAGCCTGCGGTCACCGCTTCAATGCCGCGTACGGAGCGGGTGCCGGTGGCGTATAAATTATCAAAAAGCCAGCCTTGCTGCGCCAGTTTGTCAAATGCCGGCGAAAGCGGCAAACCGCCTAAGGTGCCGATAAATTGCG > 1/419448‑419939 | cAATTTTGCCGTCTGGAAATTCAAACGGGTCATGGTTGCTGGAACTGAACACCAGACTGAAGAACGGCTTGCCTTCTTTTTGTAATTGGGTGAAGGTCTCGTTGGCTTTGGTGAACAGGTCTTCGTCGCTCACGCCCCAGGTGCCGGTAAAGGTCGGATTTTGATAATCCATTTGGTCGATAATGCGTTTGAAGCCGTTGCCGTAGAAAAAGCCCGCCATGTTGTCGAAGTGTTTTTCTCCGCCGcaaata > 1:77728/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |