| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 28,111 | G→T | intergenic (+23504/+102394) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 28,111 | 0 | G | T | 100.0% | 285.8 / NA | 100 | intergenic (+23504/+102394) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (49/51); total (49/51) | |||||||||||
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TTTTAAAATCTTCATCAGATTTTGCCACTTTTTGTTGCAAAAACTGCTTATATTCCTGTGTCATCATCATAACCTCCCTCGATTTTGGTTAATTTTAGTACAAACCAATCCATTAAGGAACCAATAACCGCCCAATTATTTAGGCGGTTATTATGAAAAATTACTCATCCACAGTAACCGAAGTAATCACCACATCCTCATTCGGCACGTCTTGATGAAAACCTTTGTTGCCGGTTTTAACGCCTTTGATTTTATCGACCACATCCATGCCTTCAACCACTTCGCCGAATACCGCATAACCCCATTCTTGCACCACTTCGCGCCCGTGCAACTCTTTTGCGCGGTAATCCAGGAAGTTGTTATCGGCAACATTAATGAAGAATTGCGCTGTCGCGGAATGCGGATCGGAGGTGCGCGCCATGGCGATGGTGCCGCGTTTGTTACTTAAACGGTTATTGGC > 1/27885‑28344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |