| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 333,629 | A→G | intergenic (‑49000/‑29698) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 333,629 | 0 | A | G | 100.0% | 275.8 / NA | 91 | intergenic (‑49000/‑29698) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (34/57); total (34/57) | |||||||||||
TTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAACTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAAGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTATCCTTCTTGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTATCTTAGGCGGTAAATTCTTAGAATCATCCGCCCGTCAG > 1/333382‑333871 | ttAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGca < 1:808419/251‑1 (MQ=255) 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gggAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTa < 1:237357/217‑1 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTat > 1:265935/1‑65 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc < 1:125534/102‑1 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc > 1:810045/1‑102 (MQ=255) cacCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTATCCTTCTTGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTAt > 1:390522/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |