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gCGTATTAAGCCGCGCTTTTGCTTCCTTAAAAGATATGACAGAATGGTGCTGGCATTTACCCAAACCTGATGGTATGTTTTATGCGTTAAAAGGTATTTATCAGCAGGAAGAAGCACAAAATTTAAGTGATCAATTTCAGATTGAAAATGTGATTTCTATTGAGGTTCCAACACTTATCGGTGAACGCCATTTAATACTTTTGACTAAAAAGTAAAATTTCTGTTAACTAt < 1:322702/231‑1 (MQ=255) gTATTAAGCCGCGCTTTTGCTTCCTTAAAAGATATGACAGAATGGTGCTGGCATTTACCCAAACCTGATGGTATGTTTTATGCGTTAAAAGGTATTTATCAGCAGGAAGAAGCACAAAATTTAAGTGATCAATTTCAGATTGAAAATGTGATTTCTATTGAGGTTCCAacac < 1:161629/172‑1 (MQ=255) gcgcTTTTGCTTCCTTAAAAGATATGACAGAATGGTGCTGGCATTTACCCAAACCTGATGGTATGTTTTATGCGTTAAAAGGTATTTATCAGCAGGAAGAAGCACAAAATTTAAGTGATCAATTTCAGATTGAAAATGTGATTTCTATTGAGGTTCCAACACTTATCGGTGAACGCCATTTAATACTTTTGACTAAAAAGTAAAATTTCTGTTAACTATCtttt > 1:467110/1‑224 (MQ=255) cgcTTTTGCTTCCTTAAAAGATATGACAGAATGGTGCTGGCATTTACCCAAACCTGATGGTATGTTTTATGCGTTAAAAGGTATTTATCAGCAGGAAGAAGCACAAAATTTAAGTGATCAATTTCAGATTGAAAATGTGATTTCTATTGAGGTTCCAACACTTATCGGTGAACGCCATTTAATACTTTTGACTAAAAAGTAAAATTTCTGTTAACTATCTTTTATTGTAGTTCATTTACCACTTTTTGAg < 1:59752/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |