| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 320,614 | A→G | intergenic (‑35985/‑42713) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 320,614 | 0 | A | G | 100.0% | 172.2 / NA | 59 | intergenic (‑35985/‑42713) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/28); total (31/28) | |||||||||||
TTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATGCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATATATTTCGTGTTTAACGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTCCCCGAAGCAAAATCGTGTTATAGGAAAATATTTGCAAATAATAAGCCTAAGGCTAAGCTGAATGCCATACTCAATAAGCCCGGCAACATGAAGCTGTGATTGAAAATGTATTTACCGATGCGTGTGGTGCCCGTAGTGTCAAAGTCGATAGAGGCAATGATCGGACCGTAGTTCGGAATGAAGAAATAACCGTTTACC > 1/320376‑320856 | ttGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATGTATTTCGTGTTTAGCGGTtaaataaa > 1:462610/1‑251 (MQ=255) 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TTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATGCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATATATTTCGTGTTTAACGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTCCCCGAAGCAAAATCGTGTTATAGGAAAATATTTGCAAATAATAAGCCTAAGGCTAAGCTGAATGCCATACTCAATAAGCCCGGCAACATGAAGCTGTGATTGAAAATGTATTTACCGATGCGTGTGGTGCCCGTAGTGTCAAAGTCGATAGAGGCAATGATCGGACCGTAGTTCGGAATGAAGAAATAACCGTTTACC > 1/320376‑320856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |