| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 319,278 | G→T | intergenic (‑34649/‑44049) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 319,278 | 0 | G | T | 100.0% | 201.6 / NA | 68 | intergenic (‑34649/‑44049) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (29/39); total (29/39) | |||||||||||
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caccatTAGCATATTTTCCCGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAAc > 1:764948/4‑185 (MQ=255) ccatTAGCATATTTTCCCGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGt > 1:797892/2‑232 (MQ=255) ttatctCCCGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTc < 1:61177/245‑1 (MQ=255) cccGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGc < 1:267297/222‑1 (MQ=255) gCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAAc < 1:387901/184‑1 (MQ=255) gAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGGTTTTtctccggataaggaaaaaagaaaaagg > 1:500266/1‑228 (MQ=255) aTGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGCAAAATGTAAATc < 1:9681/245‑1 (MQ=255) tGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGc < 1:165738/232‑1 (MQ=255) tGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATCCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGCAAAATGTAAATCGTTAAtt < 1:580783/251‑1 (MQ=255) tAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGCGGGGTTTTTCTCCGGAAAA‑GGACAAATTAAAAACGTTAAttt > 1:405005/1‑251 (MQ=255) ctgctgTGACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGCAAAATGTAAATCGTTAATTTGCAc < 1:625662/251‑1 (MQ=255) gtgACTTACCAGCGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGGTAAGCCGTTAATGGC‑GGGGTTTTTCTCCGGATAGGGCaaaaagaaaaagtttatttttctggggg > 1:587058/1‑227 (MQ=255) cGAAATTTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGCAAAATGTAAATCGTTAATTTGCACGGTGACTTCAtttt < 1:685890/248‑1 (MQ=255) | ATAGACATCAGCGTTATGCAAAAGGGCGCGGGCAAGCGCTAAACGTTGAATTTGCCCGCCGGACAAATTGCTTCCGCGACTGAGCAACGGCATCTCCAAACCGCCGTTTTCCCGCACAAAATTCGCCAGATTCACTTGTTCCAAACATTGATAAATGACTTCGTCGGAGGCATTTGATAACATCATTAGCATATTTTCCCGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATGTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCCTCGGAATA‑GGCAAAATGTAAATCGTTAATTTGCACGGTGACTTCATTTT > 1/319032‑319519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |