| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 314,246 | G→A | intergenic (‑29617/‑49081) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 314,246 | 0 | G | A | 100.0% | 214.0 / NA | 74 | intergenic (‑29617/‑49081) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/42); total (32/42) | |||||||||||
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1:713539/207‑1 (MQ=255) gCGTTGGATAGGGTAAAACGGATTCAACAAATTCACAACAGTTATTTAGGAAATATTATGTCGATGCAACAAAATTTAGCACAGCGTATCACCGAATTGGAGATGAAAGCGACCTTTCAGGAAACTGTCATTGAAGAATTGAATCAGGCATTGGt < 1:437443/155‑1 (MQ=255) gCGTTGGATAGGGTAAAACGGATTCAACAAATTCACAACAGTTATTTAGGAAATATTATGTCGATGCAACAAAATTTAGCACAGCGTATCACCGAATTGGAGATGAAAGCGACCTTTCAGGAAACTGTCATTGAAGAATTGAATCAGGCATTGGTTGAACAACAATTTATTCTGGATAAAATTCAGCTCCAGTTACGTTATCTGGCGAATAAAATACAAGATATGCAGCCTTCCAATATCGCCAGCCAAg > 1:81558/1‑250 (MQ=255) | CCGGCAATCACTTTCGCATTGTTGTAATCAATCATGCCTTTTTGTGCGTTAATTAAGCCTTGTAAATCGGAACCGAATAATACGCCTACCGCGTAAGAGGAATCATCGGTAAATTTTGCATCAGTTTTGCTTTCCGCCAAAACACCGCTAGAAACGACCGCACTTAAAATCAGCACCGGCACTGAAATTTTCTTCATTTTTAACATTGGGTTCTATCCTTTATAATAAGTAAAAAATGCGTTGGGTAGGGTAAAACGGATTCAACAAATTCACAACAGTTATTTAGGAAATATTATGTCGATGCAACAAAATTTAGCACAGCGTATCACCGAATTGGAGATGAAAGCGACCTTTCAGGAAACTGTCATTGAAGAATTGAATCAGGCATTGGTTGAACAACAATTTATTCTGGATAAAATTCAGCTCCAGTTACGTTATCTGGCGAATAAAATACAAGATATGCAGCCTTCCAATATCGCCAGCCAAG > 1/314002‑314488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |