| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,045,110 | T→G | intergenic (‑145367/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,045,110 | 0 | T | G | 100.0% | 185.1 / NA | 64 | intergenic (‑145367/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (30/34); total (30/34) | |||||||||||
AAAGGCATGCAAACAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCTTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCAC > 1/2044868‑2045341 | aaaGGCATGCAAACAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTAttt < 1:756989/251‑1 (MQ=255) gCATGCAAACAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATttgt < 1:754173/249‑1 (MQ=255) aTGCAAACAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGcc < 1:83236/251‑1 (MQ=255) aaCAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTc < 1:596415/251‑1 (MQ=255) aCAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCa > 1:119244/1‑251 (MQ=255) cAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCt > 1:804627/1‑245 (MQ=255) ttctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:11116/251‑1 (MQ=255) ttctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:602552/251‑1 (MQ=255) ttctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:205859/251‑1 (MQ=255) ttctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:814029/251‑1 (MQ=255) ttctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:12491/251‑1 (MQ=255) ctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat < 1:281720/251‑1 (MQ=255) ctttAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat < 1:771163/251‑1 (MQ=255) aTTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATAc < 1:521875/251‑1 (MQ=255) aTGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg > 1:686499/1‑228 (MQ=255) aTGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat < 1:893107/238‑1 (MQ=255) cGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCACTGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCa > 1:290909/1‑251 (MQ=255) tatGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATg < 1:793841/251‑1 (MQ=255) gCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg > 1:119621/1‑210 (MQ=255) gCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGtt > 1:354683/1‑250 (MQ=255) ccTGAAATATCCCTCACTCGAAATTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg < 1:561918/207‑1 (MQ=255) gAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat > 1:672977/1‑214 (MQ=255) ccATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat > 1:788939/1‑190 (MQ=255) ccATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat > 1:842264/1‑190 (MQ=255) ggTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCT‑AGCTAGAGCCAATCCAATGGATTGGTTTTCGTTCTTTTTGTTGCCTACTCATAATTGATAAAat > 1:329000/1‑171 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGTATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATg > 1:679585/1‑201 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAACTATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATtgt > 1:446617/1‑251 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAat < 1:628118/223‑1 (MQ=255) gCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTACGGTTAAAATTCATTGTGtttt > 1:883257/1‑251 (MQ=255) gCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat > 1:378327/1‑163 (MQ=255) ccTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGAc < 1:760591/250‑1 (MQ=255) cTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCg > 1:484538/1‑251 (MQ=255) aaaaTCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAatat > 1:280117/1‑158 (MQ=255) aGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCa < 1:869464/250‑1 (MQ=255) gCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCAcc < 1:598585/250‑1 (MQ=255) tAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAAt > 1:371923/1‑250 (MQ=255) ccccTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATcc > 1:535259/1‑249 (MQ=255) gttgtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTc > 1:451990/1‑190 (MQ=255) gttgtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAAt < 1:651009/242‑1 (MQ=255) gtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAAt > 1:74431/1‑121 (MQ=255) gtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGtat > 1:503743/1‑125 (MQ=255) gTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat > 1:898035/1‑123 (MQ=255) tCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTATCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAgg < 1:181100/251‑1 (MQ=255) gTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATAc < 1:129942/107‑1 (MQ=255) atatTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat < 1:209853/95‑1 (MQ=255) atCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATtg > 1:692465/1‑169 (MQ=255) atCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATcc < 1:833819/201‑1 (MQ=255) ccTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAAt > 1:765000/1‑244 (MQ=255) tAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg < 1:335590/68‑1 (MQ=255) ccTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg < 1:644604/62‑1 (MQ=255) ccTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATgg < 1:380859/230‑1 (MQ=255) ccTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaaca > 1:698266/1‑251 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCAcc < 1:526186/174‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAAtg < 1:12172/207‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTc > 1:602743/1‑237 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa > 1:525251/1‑251 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa < 1:136286/251‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAAGAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa < 1:439080/251‑1 (MQ=255) gCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg < 1:368687/55‑1 (MQ=255) gagCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAat > 1:556656/1‑59 (MQ=255) gagCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCa > 1:556255/1‑251 (MQ=255) aatccaatGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCa < 1:146659/251‑1 (MQ=255) atccaatGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCAc < 1:92082/251‑1 (MQ=255) aatGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATg > 1:500440/1‑41 (MQ=255) | AAAGGCATGCAAACAATAAATCGCTTTCTTTAATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCTTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCAC > 1/2044868‑2045341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |