| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,014,027 | C→A | intergenic (‑114284/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,014,027 | 0 | C | A | 100.0% | 133.3 / NA | 45 | intergenic (‑114284/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (31/14); total (31/14) | |||||||||||
ATTTTAGCGCCATAGCTAGGGTGAAAATGAATTCAATGACTAATAACCACCCCGCCCAAAAAGGTGAAATAGCAAATAAGACGGGATTAATGACAAGAAATGCGACGATCGCTATTTTATACCAGCCCGGGCTAGAACCAAGAAAGTTTTTAAAAAATGCCTGTGTATAATTACTATCCATAAAGTTGACCTTAATTTCTTAATTAACAATATATTAACCTAATACCGTTCAAGGTAGTTCAGCGCTAAACTGTGTCAAAAATAGCAGATGATGTCAACGAATTTAAAAAATAATTATCTAATTGTAATGTATAGTCGTTTCAACGATAATAAAGCCGTTTTTTATTTGATAACTACTGATAATACCGAATTACTATGAATAACAATTCCCCCCTTCTGAAAGCACAAAGCCCGGCGGCATTAGCAGAAGAATACATTGTAAAAAGCATTTGGAATAATCATTTCCCACCCGGTTCGGATTTACC > 1/2013782‑2014266 | aTTTTAGCGCCATAGCTAGGGTGAAAATGAATTCAATGACTAATAACCACCCCGCCCAAAAAGGTGAAATAGCAAATAAGATGGGATTAATGACAAGAAATGCGACGATCGCTATTTTATACCAGCCCGGGCTAGAACCAAGAAAGTTTTTAAAAAATGCCTGTGTATAATTACTATCCATAAAGTTGACCTTAATTTCTTAATTAACAATATATTAACCTAATACCGTTCAAGGTAGTTCAGCGATAAAc < 1:434340/251‑1 (MQ=255) 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ATTTTAGCGCCATAGCTAGGGTGAAAATGAATTCAATGACTAATAACCACCCCGCCCAAAAAGGTGAAATAGCAAATAAGACGGGATTAATGACAAGAAATGCGACGATCGCTATTTTATACCAGCCCGGGCTAGAACCAAGAAAGTTTTTAAAAAATGCCTGTGTATAATTACTATCCATAAAGTTGACCTTAATTTCTTAATTAACAATATATTAACCTAATACCGTTCAAGGTAGTTCAGCGCTAAACTGTGTCAAAAATAGCAGATGATGTCAACGAATTTAAAAAATAATTATCTAATTGTAATGTATAGTCGTTTCAACGATAATAAAGCCGTTTTTTATTTGATAACTACTGATAATACCGAATTACTATGAATAACAATTCCCCCCTTCTGAAAGCACAAAGCCCGGCGGCATTAGCAGAAGAATACATTGTAAAAAGCATTTGGAATAATCATTTCCCACCCGGTTCGGATTTACC > 1/2013782‑2014266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |