| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,928,669 | T→C | intergenic (‑28926/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,928,669 | 0 | T | C | 100.0% | 160.8 / NA | 56 | intergenic (‑28926/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (30/26); total (30/26) | |||||||||||
TAAGCCGGATTGTTCATCATCGCCAATCCAAAAATCAAATAAATCGCCCAGAATATACAGTTTTTCCGCTTGTGGCGCCTGTTCCTGCATAAATTGGCGAAAAAGCGCTAATAAGTGCGGTCGACTTTCTGCCAGATGTAAGTCTGCAATAAAATAGGTTTTTTGCATAGGAATTTAATTCAAGAAATTTTTCCGTTAGATTAGCACATTTAGTACTTATTAATACACTTAATTGGTTAATTTTGCTATACTGAGGCAAAATTTTAAGAGGTTTTACCATGTTAAAAATCGCCAGAATTTTCATTATTCTTCTTTGCTGCATTCTCATTTGCGTCCTCGGCACGCTCTATTCTTTCATTCGTTTTCGTAACCCAAGTAACGTGGGCATTTTCGCCCGTTGGTTCGGTCGGCTATATCCGCTTTTCGGGCTGAACGTCGAACATCGCTACCCGCCGAATACCGACAAAATCGGGCGCTGCATTTATA > 1/1928426‑1928911 | tAAGCCGGATTGTTCATCATCGCCAATCCAAAAATCAAATAAATCGCCCAGAATATACAGTTTTTCCGCTTGTGGCGCCTGTTCCTGCATAAATTGGCGAAAAAGCGCTAATAAGTGCGGTCGACTTTCTGCCAGATGTAAGTCTGCAATAAAATAGGTTTTTTGCATAGGAATTTAATTCAAGAAATTTTTCCGTTAGATTAGCACATTTAGTACTTATTAATACACTTAATTGGTTAATTTCGCTATAc < 1:13239/251‑1 (MQ=255) 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TAAGCCGGATTGTTCATCATCGCCAATCCAAAAATCAAATAAATCGCCCAGAATATACAGTTTTTCCGCTTGTGGCGCCTGTTCCTGCATAAATTGGCGAAAAAGCGCTAATAAGTGCGGTCGACTTTCTGCCAGATGTAAGTCTGCAATAAAATAGGTTTTTTGCATAGGAATTTAATTCAAGAAATTTTTCCGTTAGATTAGCACATTTAGTACTTATTAATACACTTAATTGGTTAATTTTGCTATACTGAGGCAAAATTTTAAGAGGTTTTACCATGTTAAAAATCGCCAGAATTTTCATTATTCTTCTTTGCTGCATTCTCATTTGCGTCCTCGGCACGCTCTATTCTTTCATTCGTTTTCGTAACCCAAGTAACGTGGGCATTTTCGCCCGTTGGTTCGGTCGGCTATATCCGCTTTTCGGGCTGAACGTCGAACATCGCTACCCGCCGAATACCGACAAAATCGGGCGCTGCATTTATA > 1/1928426‑1928911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |