| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,922,183 | T→C | intergenic (‑22440/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,922,183 | 0 | T | C | 100.0% | 267.5 / NA | 87 | intergenic (‑22440/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (39/48); total (39/48) | |||||||||||
ATTGTTTGTAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCATTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGATGGGTGGCAATATAGTCC > 1/1921944‑1922428 | aTTGTTTGTAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTa < 1:488417/251‑1 (MQ=255) tgtttgtAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAAc < 1:737667/251‑1 (MQ=255) tttgtAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACg < 1:566168/250‑1 (MQ=255) tttgtAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACg < 1:716220/250‑1 (MQ=255) ttgtAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACgtg < 1:815830/251‑1 (MQ=255) ttgtAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACgtg < 1:378089/251‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAAt < 1:293581/251‑1 (MQ=255) aGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTg > 1:893161/1‑251 (MQ=255) cTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACg < 1:623976/200‑1 (MQ=255) ttCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACgt < 1:534744/200‑1 (MQ=255) ttCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACg > 1:621967/1‑225 (MQ=255) ccACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACgtg < 1:134190/199‑1 (MQ=255) cACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGt < 1:507862/231‑1 (MQ=255) aCCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGt > 1:855771/1‑250 (MQ=255) ccTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGc < 1:322812/240‑1 (MQ=255) aTCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTaa > 1:636753/1‑251 (MQ=255) cAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGt < 1:713039/250‑1 (MQ=255) taataaGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGAtt < 1:846825/170‑1 (MQ=255) taataaGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGt < 1:243793/209‑1 (MQ=255) taataaGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATca > 1:372994/1‑250 (MQ=255) taataaGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCATCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCAATTGGTTTAATAATACGTCACCGCAAGTCTTTAATTTATCCATGTCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGAtt < 1:873319/170‑1 (MQ=255) gAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTaa < 1:199077/162‑1 (MQ=255) cccACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAat < 1:98143/200‑1 (MQ=255) ccACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGtgaa < 1:723933/251‑1 (MQ=255) cTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAat < 1:323075/196‑1 (MQ=255) gAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACg > 1:413280/1‑179 (MQ=255) gAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTgaatgaat > 1:47596/1‑251 (MQ=255) aaaaTAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACg < 1:293987/152‑1 (MQ=255) aTAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGt > 1:37591/1‑170 (MQ=255) aaCGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGa < 1:681754/251‑1 (MQ=255) cGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGtt > 1:687086/1‑251 (MQ=255) gCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGt < 1:842232/160‑1 (MQ=255) cTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTa < 1:104012/250‑1 (MQ=255) cTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTa < 1:265565/250‑1 (MQ=255) tCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAg < 1:663012/251‑1 (MQ=255) tCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAg < 1:295515/251‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTg < 1:133707/251‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTg < 1:95779/251‑1 (MQ=255) aTGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTg > 1:848846/1‑250 (MQ=255) tttCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTa > 1:382679/1‑251 (MQ=255) gAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACggg < 1:594072/153‑1 (MQ=255) gAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGtgaatg < 1:468163/220‑1 (MQ=255) gAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGAttt > 1:4962/1‑251 (MQ=255) tCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTAt < 1:517896/251‑1 (MQ=255) tCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTAt < 1:419501/251‑1 (MQ=255) cATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATc < 1:588951/251‑1 (MQ=255) cGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCaa > 1:770015/1‑251 (MQ=255) cAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGt < 1:257443/163‑1 (MQ=255) cAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATca > 1:121734/1‑173 (MQ=255) cAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGAttt > 1:510412/1‑251 (MQ=255) gTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGAtttt < 1:326377/222‑1 (MQ=255) aaCCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTa > 1:851236/1‑203 (MQ=255) aCCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGAtt < 1:895774/86‑1 (MQ=255) aCCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATc < 1:283434/251‑1 (MQ=255) aCCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATc < 1:653442/251‑1 (MQ=255) tGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCg > 1:111548/1‑250 (MQ=255) ggTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTAt > 1:590939/1‑223 (MQ=255) ggTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGc > 1:808730/1‑250 (MQ=255) ggTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGc > 1:892523/1‑250 (MQ=255) gTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAATGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGcc < 1:454755/250‑1 (MQ=255) gTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGc > 1:740607/1‑146 (MQ=255) gTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGtgaatg > 1:192499/1‑177 (MQ=255) gTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGCGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCa > 1:781065/1‑251 (MQ=255) aataatACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATca > 1:494222/1‑154 (MQ=255) taataCGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGcc > 1:632934/1‑244 (MQ=255) ataCGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGa > 1:887300/1‑251 (MQ=255) ccGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATcgccgc > 1:561767/1‑250 (MQ=255) tCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAg < 1:886115/181‑1 (MQ=255) tCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATaaa > 1:404316/1‑251 (MQ=255) tCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATaaa > 1:424197/1‑251 (MQ=255) tCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATaaa > 1:311496/1‑251 (MQ=255) cTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTa > 1:80668/1‑170 (MQ=255) cTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTa > 1:288857/1‑170 (MQ=255) tttAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAAt < 1:193918/251‑1 (MQ=255) agacatATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAAt < 1:804648/244‑1 (MQ=255) aaTTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAAt < 1:648110/248‑1 (MQ=255) aTCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGcc > 1:133545/1‑194 (MQ=255) aTCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCtt > 1:260400/1‑251 (MQ=255) tCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCtt > 1:691071/1‑250 (MQ=255) ggcatggGAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGAttt > 1:369357/1‑251 (MQ=255) ggAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGa < 1:872849/250‑1 (MQ=255) ggAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGa < 1:169843/250‑1 (MQ=255) ggAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGAt > 1:128585/1‑251 (MQ=255) ggAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGAt > 1:551307/1‑251 (MQ=255) ggAAAAATCTTCATCAATTTCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGAt > 1:477527/1‑251 (MQ=255) tttCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGATGGGTGGCAATATAGTcc < 1:688533/251‑1 (MQ=255) tttCACTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGATGGGTGGCAATATAGTcc < 1:601511/251‑1 (MQ=255) | ATTGTTTGTAAATTCTTAACGCCTGCGCATCATCAAGATAAAAATGCGCCGCGCCTTCCACCTTATCCAGCAAATGCAGATAATAAGGCAGAATCCCCACTGAAAATAAACGGTCGCTCAATGCTTTCAGAATATGGGCATCGTCATTCACGTTTTTCAGTAAAACCGATTGGTTTAATAATACGACACCGCAATTCTTTAATTTATCCATGGCATGGGAAAAATCTTCATCAATTTCATTGGCATGATTAACGTGTGTGACCAGAATTTTCTGTAAACGGGTTTGCGTCAGAATATGGCAAAATTTGTCGGTAATGCGTTGCGGAATCACCACCGGCAAACGTGAATGAATGCGCAGACGTGTTAAGTGCGGTAGATTTTCCAGGTGTTTTATCAGCCAAGCGATTTCATGATCCTTCGCCATAAGCGGATCGCCGCCGGATAAAATCACCTCTTCGATTTCCGGATGGGTGGCAATATAGTCC > 1/1921944‑1922428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |