| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,909,791 | A→G | intergenic (‑10048/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,909,791 | 0 | A | G | 100.0% | 168.7 / NA | 58 | intergenic (‑10048/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/27); total (31/27) | |||||||||||
ATAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACAGAATGTAGGTTGAGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAACCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAATACCCTTAACCTTCCCGAAACGGGCTTTCCGATGCGTGGCGATTTAGCCAAACGTGAGCCTGTGATGTTGAAAAATTGGTATGAGAAAGATCTTTACCAAAAAATCCGTCAGGCGACCAAAGGCAAGAAATCCTTTATTTTGCACGACGGTCCTCCTTATGCCAACG > 1/1909544‑1910031 | aTAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACACAATGTAGGTTGAGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAGccc < 1:747369/251‑1 (MQ=255) 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aGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATaaaa < 1:244010/250‑1 (MQ=255) gCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATTTTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAAt > 1:712109/1‑251 (MQ=255) gCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGaaaa > 1:723741/1‑234 (MQ=255) 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aTGTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAATACCCTTAACCTTCCCGAAACGGGCTTTCCGATGCGTGGCGATTTAGCCAAACGTGAGCCTGTGATGTTGAAAAATTGGTATGAGAAAGATCTTTACCAAAAAATCCGTCAGGCGACCAAAGGCAAGAAATCCTTTATTTTGCACGACGGTCCTCCTTATGcc > 1:801193/1‑249 (MQ=255) gTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAATACCCTTAACCTTCCCGAAACGGGCTTTCCGATGCGTGGCGATTTAGCCAAACGTGAGCCTGTGATGTTGAAAAATTGGTATGAGCAAGATCTTTACCAAAAAATCCGTCAGGCGACCAAAGGCAAGAAATCCTTTATTTTGCACGACGGTCCTCCTTATGCCAACg > 1:441010/1‑251 (MQ=255) gTAACACATAGCCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAATACCCTTAACCTTCCCGAAACGGGCTTTCCGATGCGTGGCGATTTAGCCAAACGTGAGCCTGTGATGTTGAAAAATTGGTATGAGAAAGATCTTTACCAAAAAATCCGTCAGGCGACCAAAGGCAAGAAATCCTTTATTTTGCACGACGGTCCTCCTTATGCCAACg > 1:592086/1‑251 (MQ=255) | ATAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACAGAATGTAGGTTGAGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAACCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAAATGACTGATTATAAAAATACCCTTAACCTTCCCGAAACGGGCTTTCCGATGCGTGGCGATTTAGCCAAACGTGAGCCTGTGATGTTGAAAAATTGGTATGAGAAAGATCTTTACCAAAAAATCCGTCAGGCGACCAAAGGCAAGAAATCCTTTATTTTGCACGACGGTCCTCCTTATGCCAACG > 1/1909544‑1910031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |