| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,908,383 | A→G | intergenic (‑8640/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,908,383 | 0 | A | G | 100.0% | 234.1 / NA | 78 | intergenic (‑8640/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/38); total (40/38) | |||||||||||
TGTCGGCGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTATTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATACCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAA > 1/1908136‑1908628 | tGTCGGCGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTg < 1:661059/251‑1 (MQ=255) gCGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGAt > 1:351682/1‑251 (MQ=255) cGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGTCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGAt < 1:802917/250‑1 (MQ=255) cGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGAt < 1:283079/250‑1 (MQ=255) gACACTCAACGCGTTTTTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGAtt < 1:641653/250‑1 (MQ=255) cTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCaa > 1:140699/1‑251 (MQ=255) aCGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGCGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGt > 1:217073/1‑251 (MQ=255) tttCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGAtt < 1:787141/250‑1 (MQ=255) cgGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACg < 1:410437/241‑1 (MQ=255) cgGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCAc < 1:633658/250‑1 (MQ=255) gCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTc < 1:898344/250‑1 (MQ=255) ggCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGt > 1:729233/1‑251 (MQ=255) gtATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGAttt > 1:208005/1‑216 (MQ=255) gtATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACg > 1:417275/1‑220 (MQ=255) gtATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACg < 1:762989/220‑1 (MQ=255) gtATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTtgt > 1:666709/1‑251 (MQ=255) gtATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTtgt > 1:347687/1‑251 (MQ=255) gTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGc > 1:491233/1‑248 (MQ=255) gAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTAttt > 1:674508/1‑251 (MQ=255) ttttGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTAtttttt < 1:772378/249‑1 (MQ=255) ttttGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTc < 1:716375/250‑1 (MQ=255) gtttgCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGAtt > 1:151610/1‑218 (MQ=255) tgCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAAt < 1:141568/251‑1 (MQ=255) ccgTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTAt < 1:51790/250‑1 (MQ=255) gTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCAc > 1:12537/1‑174 (MQ=255) catcatGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAac < 1:177148/251‑1 (MQ=255) tcatGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAaca > 1:567521/1‑250 (MQ=255) tcatGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGAGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAaca > 1:120178/1‑250 (MQ=255) tgttgGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGc < 1:1881/251‑1 (MQ=255) ggtttggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTc < 1:846961/159‑1 (MQ=255) tggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGc < 1:571673/192‑1 (MQ=255) tggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAac > 1:144860/1‑232 (MQ=255) tggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGAtt > 1:290199/1‑251 (MQ=255) ggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGAtt > 1:57865/1‑250 (MQ=255) ggtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGAtt > 1:410918/1‑250 (MQ=255) gtACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATg < 1:528840/226‑1 (MQ=255) tACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCg < 1:2855/250‑1 (MQ=255) caacaGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAgg < 1:416757/251‑1 (MQ=255) gCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCAc < 1:563834/143‑1 (MQ=255) gCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGc < 1:746613/233‑1 (MQ=255) gCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAAtt > 1:474765/1‑251 (MQ=255) cGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCa > 1:152167/1‑251 (MQ=255) gATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACATATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCa > 1:225351/1‑250 (MQ=255) atatGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACg > 1:123472/1‑251 (MQ=255) ttCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGTTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACTGAAATTTATGGAACAAATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGt > 1:31601/1‑251 (MQ=255) ttCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGt < 1:94178/251‑1 (MQ=255) cACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAAc < 1:46243/251‑1 (MQ=255) aCCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAAcc < 1:67323/251‑1 (MQ=255) cccGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGAt < 1:337934/137‑1 (MQ=255) cccGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTa > 1:500803/1‑159 (MQ=255) cccGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCa > 1:76263/1‑251 (MQ=255) cccGTGTACATTAGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCa > 1:719827/1‑251 (MQ=255) cGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGc < 1:885827/141‑1 (MQ=255) cGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATgg > 1:647289/1‑178 (MQ=255) ggCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTgggg < 1:405182/62‑1 (MQ=255) ggCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTg > 1:513700/1‑251 (MQ=255) ggCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTg > 1:568719/1‑251 (MQ=255) cTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGAt < 1:126848/251‑1 (MQ=255) aCGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATgg > 1:571103/1‑250 (MQ=255) aCGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGc < 1:246896/251‑1 (MQ=255) cTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATACAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCAt > 1:429350/1‑251 (MQ=255) aTCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTg < 1:106191/251‑1 (MQ=255) cGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAg > 1:238867/1‑129 (MQ=255) tgtTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAAttt < 1:735557/189‑1 (MQ=255) tGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTAttt < 1:99390/251‑1 (MQ=255) tGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTAttt < 1:626992/251‑1 (MQ=255) ggTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTataatgc < 1:188145/109‑3 (MQ=255) ggTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGt > 1:607844/1‑202 (MQ=255) ggTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGt < 1:280713/202‑1 (MQ=255) gTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCGTCTGGGGCATCAAGCTATTTTg > 1:597775/1‑251 (MQ=255) gTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTg > 1:416020/1‑251 (MQ=255) gTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTg > 1:881925/1‑251 (MQ=255) gTGGCATGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAGGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCAtt > 1:818306/1‑251 (MQ=255) tGTTGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTa < 1:737219/200‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGc > 1:108141/1‑84 (MQ=255) ttGGTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGaa > 1:636804/1‑251 (MQ=255) gTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATgg < 1:732576/118‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGaaaaa > 1:172248/1‑251 (MQ=255) | TGTCGGCGACACTCAACGCGTTTCTGCTTTATCGCGGCTTGGCGAAAGCCGATGTGTATCATTTCAGCCGACAAAGTGCGGTCTTTTTTCTGAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTATTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATACCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAA > 1/1908136‑1908628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |