| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,859,504 | T→G | intergenic (‑23841/+24125) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,859,504 | 0 | T | G | 100.0% | 225.5 / NA | 76 | intergenic (‑23841/+24125) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (32/44); total (32/44) | |||||||||||
CACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAATTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTAAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTAGCCTATAGCAAGCCTGAATTAGATGGCAGAAC > 1/1859258‑1859749 | cACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCa > 1:836997/1‑250 (MQ=255) 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1:296866/251‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAg > 1:505858/1‑250 (MQ=255) ttGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAg < 1:250472/251‑1 (MQ=255) gCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGgtatcataactcgtat < 1:119815/244‑15 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGt < 1:712797/162‑1 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAgg < 1:613729/187‑1 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAGCCTGAATTa > 1:198622/1‑251 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAGCCTGAATTa > 1:81925/1‑251 (MQ=255) 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CACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAATTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTAAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTAGCCTATAGCAAGCCTGAATTAGATGGCAGAAC > 1/1859258‑1859749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |