| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,832,565 | A→G | intergenic (+50665/+2819) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,832,565 | 0 | A | G | 100.0% | 252.1 / NA | 83 | intergenic (+50665/+2819) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/52); total (31/52) | |||||||||||
GGTCAGAAAACCGGCGATAATCACATTATTCTCCGATAATTTGTTATCGGAAATGGAAAACGGAATAGCGGTCTGCGGCGTTGCATTTTGCCCGAACACGGCGCGGATATAGGGCGTGTATTTATCAATATCCGCCACCATCACAATAATGTCTTTCGGCGTTAAATCAGGATTC‑T‑GTTGCAGCAAATGCAGCAAATAATCCTGCAACACTTCCACTTCGCGCATCATGCTGTGGCAGGAATGGAAAGTTAAAGTGCGGTCATTTTCCCGATAGTTTAACGGCGTGGTGCCGTTCGGTGTTAAATGCAAAATACGATGTTGGATCTGGCTTAATAAATTGTGCGGCATGATTTCCACATAGGCGGAAATGTCATTGGGTTCCAGCTGCGCCAATAAGTAGGAAAAATCCCGTCCCAGCTTACCCCAAGATGCCAATAAGGAATTACCCACCTGTAATTTTTCCTGCGCATAAGTCAGCTCCCAATGTTGC > 1/1832319‑1832808 | ggTCAGAAAACCGGCGATAATCACGTTATTCTCCGATAATTTGTTATCGGAAATGGAAAACGGAATAGCGGTCTGCGGCGTTGCATTTTGCCCGAATACAGCGCGGATATACGGTGTGTATTTATCAATATCCGCCACCATCACAATAATGTCTTTCGGCGTTAAATC‑GGGTTCTT‑GTTGCAACAAATGTAGCAAATAATCCTGCAACACTTCCACTTCGCGCATCATGCTGTGGCAGGAATGGAAGGTTa > 1:876320/1‑251 (MQ=255) 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tcatGCTGTGGCAGGAATGGAAGGTTAAAGTGCGGTCATTTTCCCGATAGTTTAACGGCGTGGAGCCATTCGGAGTTAAATGCAAAATACGGTGTTGGATTTGGCTTAATAAATTGTGCGGCGTGATTTCCACATAGGCAGAAATATCATTGGGTTCCAGCTGCGCCAATAAGTAGGAAAAATCCCGTCCCAGCTTACCCCAAGATGCCAATAAGGAATTACCCACCTGTAATTTTTCCTGCGCATAAGTc < 1:626851/251‑1 (MQ=255) tcatGCTGTGGCAGGAATGGAAGGTTAAAGTGCGGTCATTTTCCCGATAGTTTAACGGCGTGGAGCCATTCGGAGTTAAATGCAAAATACGGTGTTGGATTTGGCTTAATAAATTGTGCGGCGTGATTTCCACATAGGCAGAAATATCATTGGGTTCCAGCTGCGCCAATAAGTAGGAAAAATCCCGTCCCAGCTTACCCCAAGATGCCAATAAGGAATTACCCACCTGTAATTTTTCCTGCGCATAAGTc < 1:729703/251‑1 (MQ=255) atGCTGTGGCAGGAATGGAAGGTTAAAGTGCGGTCATTTTCCCGATAGTTTAACGGCGTGGAGCCATTCGGAGTTAAATGCAAAATACGGTGTTGGATTTGGCTTAATAAATTTTGCGGCGTGATTTCCACATAGGCAGAAATATCATTGGGTTCCAGCTGCGCCAATAAGTAGGAAAAATCCCGTCCCAGCTTACCCCAAGATGCCAATAAGGAATTACCCACCTGTAATTTTTCCCGCGCATAAGTCAg > 1:502266/1‑251 (MQ=255) 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GGTCAGAAAACCGGCGATAATCACATTATTCTCCGATAATTTGTTATCGGAAATGGAAAACGGAATAGCGGTCTGCGGCGTTGCATTTTGCCCGAACACGGCGCGGATATAGGGCGTGTATTTATCAATATCCGCCACCATCACAATAATGTCTTTCGGCGTTAAATCAGGATTC‑T‑GTTGCAGCAAATGCAGCAAATAATCCTGCAACACTTCCACTTCGCGCATCATGCTGTGGCAGGAATGGAAAGTTAAAGTGCGGTCATTTTCCCGATAGTTTAACGGCGTGGTGCCGTTCGGTGTTAAATGCAAAATACGATGTTGGATCTGGCTTAATAAATTGTGCGGCATGATTTCCACATAGGCGGAAATGTCATTGGGTTCCAGCTGCGCCAATAAGTAGGAAAAATCCCGTCCCAGCTTACCCCAAGATGCCAATAAGGAATTACCCACCTGTAATTTTTCCTGCGCATAAGTCAGCTCCCAATGTTGC > 1/1832319‑1832808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |