| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,830,229 | G→A | intergenic (+48329/+5155) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,830,229 | 0 | G | A | 100.0% | 145.8 / NA | 54 | intergenic (+48329/+5155) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (25/29); total (25/29) | |||||||||||
GAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATCCAATTCCTGCGTTTGCACCAGTACTCGCCGCCAATATAAATCGCCAGGCGAACG > 1/1829986‑1830464 | gAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATg > 1:200657/1‑251 (MQ=255) aaaaTAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGAt < 1:802180/251‑1 (MQ=255) aaaaTAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGG‑GCGGGGCTTGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGaa > 1:384132/1‑250 (MQ=255) aataatCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTc < 1:768447/251‑1 (MQ=255) 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gTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGGGGGGAGGGCGGGGTATTTTTAGGCtt > 1:526513/1‑250 (MQ=255) gTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAACCCTGGCACTGTTTGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCCGCGTATTTATAGGCTa > 1:259826/1‑251 (MQ=255) gTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAAAAAAAAACCCCTGGCACTGTATGATTTGCTGGGCCTTAATCAAGGGGATATTCGCAAAAATTATTATcc > 1:640892/1‑195 (MQ=255) 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cagttAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCATGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCggtgc > 1:43860/4‑208 (MQ=255) agttAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTccc < 1:891845/183‑1 (MQ=255) gttAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGAtt > 1:329939/2‑77 (MQ=255) gttAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCgtgg < 1:768900/151‑1 (MQ=255) ttAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTAACCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATcc < 1:612179/248‑1 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ggCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATCCAATTCCTGCGTTTGCACCAGTACGcgccgc > 1:101193/1‑250 (MQ=255) aaGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATCCAATTCCTGCGTTTGCACCAGTACGCGCCGCCAatat < 1:88511/250‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATCCAATTCCTGCGTTTGCACCAGTACGCGCCGCCAATATAAATCGCCAGGCGAAcg > 1:56672/1‑250 (MQ=255) | GAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTCAAATCCAATTCCTGCGTTTGCACCAGTACTCGCCGCCAATATAAATCGCCAGGCGAACG > 1/1829986‑1830464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |