| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,829,566 | A→G | intergenic (+47666/+5818) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,829,566 | 0 | A | G | 100.0% | 224.3 / NA | 79 | intergenic (+47666/+5818) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (43/36); total (43/36) | |||||||||||
TAAAAAATCCAAATGCCGTTCCAACACTTCGCTTTCTGCACAAATCACGCTATTAATCCTATGGCTTATTGGTTAAAATGGGCGCCCATTATACTGGATTGAATTGATTTTAGATATGCAAAAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGTCGTGCCCGAATCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCATACAGGATCTGTTGCGCAGTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGATGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGTTGAATGTCTGGCAATCCGTCGATCTCG > 1/1829329‑1829807 | tAAAAAATCCAAATGCCGTTCCAACACTTCGCTTTCTGCACAAATCACGCTATTAATCCTATGGCTTATTGGTTAAAATGGGCGCCCATTATACTGGATTGAATTGATTTTAGATATGCAAGAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTgg > 1:565476/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gaTTTTAGATATGCAAGAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGagcag > 1:410268/1‑250 (MQ=255) aTTTTAGATATGCAAGAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGc > 1:532736/1‑229 (MQ=255) ttttAGATATGCAAGAAACGCGCCGACACCCTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGagcag < 1:452427/248‑1 (MQ=255) atatGCAAGAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTg > 1:14538/1‑146 (MQ=255) 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ccgAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGc < 1:784097/251‑1 (MQ=255) gaTTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAatat > 1:85864/1‑194 (MQ=255) ttGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATaaaaa < 1:298704/251‑1 (MQ=255) ttGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATaaaaa < 1:349097/251‑1 (MQ=255) gcagcaAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACcac < 1:232085/220‑1 (MQ=255) cagcaAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCacac < 1:293339/157‑1 (MQ=255) gcaAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATc < 1:294965/110‑1 (MQ=255) ggCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAAt > 1:668132/1‑251 (MQ=255) gCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAg > 1:727251/1‑148 (MQ=255) cAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAatta < 1:438779/212‑1 (MQ=255) cAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAg > 1:755473/1‑251 (MQ=255) ttGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATaaaa < 1:559576/220‑1 (MQ=255) cccTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCaa > 1:321134/1‑250 (MQ=255) gCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCTCCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCtcac < 1:374220/179‑1 (MQ=255) gCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGtt > 1:520356/1‑251 (MQ=255) gCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGtt > 1:448539/1‑251 (MQ=255) cTTAAAAGGCGCGATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGTTGa > 1:817068/1‑251 (MQ=255) cgATTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGTTGAATGTCTGGCaa < 1:168220/251‑1 (MQ=255) aTTAATATCGCCGTGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCaacaac < 1:604418/67‑1 (MQ=255) gtGCCCGAGTCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCGCGCAGGACCTGTTGCGCGCTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGACGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGTTGAATGTCTGGCAATCCGTCGATCTcg > 1:741045/1‑250 (MQ=255) | TAAAAAATCCAAATGCCGTTCCAACACTTCGCTTTCTGCACAAATCACGCTATTAATCCTATGGCTTATTGGTTAAAATGGGCGCCCATTATACTGGATTGAATTGATTTTAGATATGCAAAAAACGCGCCGACACACTTCCCGCCGAGATTTATTATTGCAGCAAATGGGCATCAGCCAATGGCAATTGGTGCGCCCTGAAGCCTTAAAAGGCGCGATTAATATCGTCGTGCCCGAATCGGTTCGTTTGGTTATCGTGAGCCATCAAAATCTGTTGCAACAACCCATCATACAGGATCTGTTGCGCAGTCTCACACTTGATAGCACGCAAGTGCTGAATATCACCTTTGAGCAGCTTGCCTATTTGCAAGTCAACCACACCGTCAATTATTGGCTACTCCATAAAAACGCCGATGAAATCCACCGCACTTTAAGCGGGCTGCAACAGCCGTTGAATGTCTGGCAATCCGTCGATCTCG > 1/1829329‑1829807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |