| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,821,564 | A→C | intergenic (+39664/+13820) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,821,564 | 0 | A | C | 100.0% | 169.0 / NA | 57 | intergenic (+39664/+13820) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (26/31); total (26/31) | |||||||||||
CTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGCTCAAATGACACATCTTTGAGATTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGCCCATATTCTTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGGTCATCGCCTTCTCCACCGTCAAGTAAATCATCTCCTTGGTTTCCAAACAACTTATCATTGCCACTTCCACCTCTTAGAATATCGGAACCATTGCCTCCCTCTAAGTGGTCGTCGCCTTCTCCA > 1/1821318‑1821810 | cTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGTTCAAATGACACCTCtt > 1:881486/1‑251 (MQ=255)cTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGTTCAAATGACACCTCtt > 1:253802/1‑251 (MQ=255) cATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGTTCAAATGACACCTCTTTgagg > 1:411760/1‑250 (MQ=255) ttcttcAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGTTCAAATGACACCTCTTTGAGGTTGATATTTGCTAATg > 1:503510/1‑251 (MQ=255) 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acacCTCTTTGAGGTTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGGCCATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTtcacc < 1:47213/250‑4 (MQ=255) | CTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGCTCAAATGACACATCTTTGAGATTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGCCCATATTCTTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGGTCATCGCCTTCTCCACCGTCAAGTAAATCATCTCCTTGGTTTCCAAACAACTTATCATTGCCACTTCCACCTCTTAGAATATCGGAACCATTGCCTCCCTCTAAGTGGTCGTCGCCTTCTCCA > 1/1821318‑1821810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |