| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,821,270 | G→A | intergenic (+39370/+14114) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,821,270 | 0 | G | A | 100.0% | 213.3 / NA | 74 | intergenic (+39370/+14114) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/33); total (41/33) | |||||||||||
GTAGTTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATAATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGTCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTGTTCCCACTCTTATCAAAAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTG > 1/1821031‑1821508 | gtagtTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCActttt > 1:571617/1‑248 (MQ=255) tttGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATc < 1:40514/251‑1 (MQ=255) cGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAAt < 1:319195/250‑1 (MQ=255) tAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGt < 1:315725/250‑1 (MQ=255) gTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCa > 1:47268/1‑229 (MQ=255) aGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTa > 1:478662/1‑251 (MQ=255) gTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTaa > 1:191228/1‑251 (MQ=255) tattatTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAAt > 1:469648/1‑250 (MQ=255) attattGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATcc < 1:654082/251‑1 (MQ=255) ttattGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCg > 1:270770/1‑251 (MQ=255) gTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTccc > 1:549158/1‑250 (MQ=255) gTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTccc > 1:467731/1‑250 (MQ=255) gCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCa < 1:232122/209‑1 (MQ=255) tGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTAc < 1:420054/251‑1 (MQ=255) aCGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATc > 1:132587/1‑221 (MQ=255) aCGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCa > 1:826226/1‑251 (MQ=255) cGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCaagaag > 1:116904/1‑195 (MQ=255) tttACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACtt < 1:135969/251‑1 (MQ=255) ggATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAAc < 1:831908/243‑1 (MQ=255) gATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTtattat < 1:502588/250‑1 (MQ=255) gATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTtattat < 1:328570/250‑1 (MQ=255) gAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATc > 1:775740/1‑218 (MQ=255) aaCCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGt < 1:474385/202‑1 (MQ=255) aaCCAAAACCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCt > 1:733555/1‑218 (MQ=255) aaCCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATATGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTg > 1:849060/1‑251 (MQ=255) aCCACTGGTTGCTGAAATCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGt < 1:159991/251‑1 (MQ=255) cTGAAATCATACGACTAAGATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATGTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTAcc < 1:25618/250‑1 (MQ=255) aaaTCATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGc < 1:154111/251‑1 (MQ=255) aatcataCGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCg > 1:61916/5‑249 (MQ=255) aCTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCa > 1:568018/1‑145 (MQ=255) aaTATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGc < 1:542454/175‑1 (MQ=255) aaaCCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATGGTCTCTTAAGTCg < 1:225168/251‑1 (MQ=255) aaCCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCaa < 1:734481/141‑1 (MQ=255) aaCCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTAc < 1:464014/174‑1 (MQ=255) tgtAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCttt < 1:505698/250‑1 (MQ=255) aaGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAg > 1:226487/1‑251 (MQ=255) aGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTc > 1:186107/1‑248 (MQ=255) cATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAgg < 1:613766/249‑1 (MQ=255) cATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAgg < 1:67658/249‑1 (MQ=255) tACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCg > 1:87733/1‑251 (MQ=255) aacgaGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAg < 1:260453/217‑1 (MQ=255) aacgaGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCaaga > 1:828518/1‑251 (MQ=255) aacgaGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCaag < 1:597095/250‑1 (MQ=255) cgaGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGTTAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCaagaag < 1:473659/251‑1 (MQ=255) cgaGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCaagaag < 1:309247/251‑1 (MQ=255) agaagaagaCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGtt > 1:565911/1‑251 (MQ=255) gaCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTg > 1:183874/1‑251 (MQ=255) aCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTtattat > 1:289047/1‑156 (MQ=255) aCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTc > 1:580618/1‑223 (MQ=255) aCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGa > 1:596404/1‑251 (MQ=255) cATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGAt > 1:81999/1‑251 (MQ=255) aGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTc > 1:241097/1‑241 (MQ=255) aGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACt > 1:596827/1‑250 (MQ=255) ggCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGAc > 1:597716/1‑166 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTg > 1:220294/1‑176 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTc > 1:303181/1‑182 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATc > 1:827513/1‑209 (MQ=255) gACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGt > 1:230166/1‑192 (MQ=255) aCCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCtt > 1:197116/1‑229 (MQ=255) ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTg < 1:203460/138‑1 (MQ=255) ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGa > 1:647766/1‑251 (MQ=255) ttCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAAtt > 1:285819/1‑251 (MQ=255) cccGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTatta < 1:101569/249‑4 (MQ=255) cGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAc < 1:513418/251‑1 (MQ=255) cGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAc < 1:155929/251‑1 (MQ=255) gCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAAcc < 1:755845/250‑1 (MQ=255) gCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATc > 1:513062/1‑249 (MQ=255) ctctTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTc < 1:148107/177‑1 (MQ=255) ctctTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCtt > 1:715767/1‑251 (MQ=255) tGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTaaa < 1:358899/251‑1 (MQ=255) gTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATg < 1:782172/249‑1 (MQ=255) gTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTActg > 1:253655/1‑247 (MQ=255) cTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGt > 1:151538/1‑142 (MQ=255) ttttATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGt > 1:214301/1‑215 (MQ=255) | GTAGTTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATAATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGTCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTGTTCCCACTCTTATCAAAAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTG > 1/1821031‑1821508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |