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aCATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGa > 1:596404/1‑251 (MQ=255) cATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGAt > 1:81999/1‑251 (MQ=255) aGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTc > 1:241097/1‑241 (MQ=255) aGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACt > 1:596827/1‑250 (MQ=255) ggCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGAc > 1:597716/1‑166 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTg > 1:220294/1‑176 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTc > 1:303181/1‑182 (MQ=255) cTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATc > 1:827513/1‑209 (MQ=255) gACTTACCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGt > 1:230166/1‑192 (MQ=255) aCCTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCtt > 1:197116/1‑229 (MQ=255) ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTg < 1:203460/138‑1 (MQ=255) ccTTTATTCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGa > 1:647766/1‑251 (MQ=255) ttCTTAATAAGCCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTATTCCCACTTTTATCAAGAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAAtt > 1:285819/1‑251 (MQ=255) | ATATGCGGAATCACTAAAAAGCCAATAACTCATTAAGCAGTAGTTGCTAACGAATTTGCGTAAGAGTTAAAGTTATTATTGGTCTGCAATGGCGAAGCGGATAACGCTTTACCGGATGAACCAAAACCACTGGTTGCTGAAATAATACGACTAATATCATTTGACAAACCGGACTTTTGTGTAAGCATACTTGACGAACGAGAAGAAGACATAAGGCTACTTGACTTACCTTTATTCTTAATAAGTCCGGCAAGCTCTTGAGGTGAAATTGTCTTTTTGTTCCCACTCTTATCAAAAAGATTATCAATGTCTTGCGAAGTAATCCGCTCCCCATCTTTACCGATAATTTCTTCAACTTTATTATTGAGTGATTTGTCGACTTTACCTCGCTGTAACTCAAATTGTCTCTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATT > 1/1820992‑1821476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |