| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,820,710 | T→G | intergenic (+38810/+14674) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,820,710 | 0 | T | G | 100.0% | 124.9 / NA | 42 | intergenic (+38810/+14674) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (17/25); total (17/25) | |||||||||||
CGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACGGCAGGAATAAACCAGGTAAAGTCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGATGCAATTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGAATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTTAATAAAATAAAGTGTTCACCATCATCACGCCAAGCCAATGCCGGTAAATGTAAAAAAGGCAATCTGTCAACTGTTTTGTTCGCAGTTCTTACCTTTAATCCAAGTGATTTTGCTGCAAGCAACCATTTAGTTTGGTTCAGCCCATGCCCATCTATATCAAATTTATGTTTTATTTCTTCCGGGTTAATTGAAATATTATGATATTGAGCCAGTACTTCCAATGCCTGAAGGGCAAGATTAGTATTTTTCTG > 1/1820478‑1820946 | cGATTAACGTTTCTATAAAAATTTTGCGGTATTTAATTACAGCAGGAATAAACCAGGTAAAATCGAATTTTGCTAAATTTCCTACAATAGATGCGCGTGACGCAACTAAAATCACCTTGCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTCAATAAAATAAAGTGGTCACCATCATCACgccaa > 1:885193/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gCTTTGATAACGTTCTTCAAATTCATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTCAATAAAATAAAGTGGTCACCATCATCACGCCAAGCCAATACCGGTAAATGTAAAAAAGGTAATCt < 1:505711/165‑1 (MQ=255) cttcAAATTCA‑TTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTCAATAAAATAAAGTGGTCACCATCATCACGCCAAGCCAATACCGGTAAATGTAAAAAAGGTAATCTATCAATTGTTTTGTTCGTAGTTCTTACTTTTAATCCAAGTGATCTTGCTGCAAGCAACCATTTAGTTTGGTTCAGCCCATGCCCATCTATATCAAATTTAt > 1:611760/1‑251 (MQ=255) cATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTCAATAAAATAAAGTGGTCACCATCATCACGCCAAGCCAAtacc > 1:197240/1‑116 (MQ=255) cATTTTTGTCTAAAACAATAGGATTTTTTTGCATTAGATCAAAAATGAGGTAACGATCGGTTTCTTGATCTATTTTCAATAAAATAAAGTGGTCACCATCATCACGCCAAGCCAATACCGGTAAATGTAAAAAAGGTAATCTATCAATTGTTTTGTTCGTAGTTCTTACTTTTAATCCAAGTGATCTTGCTGCAAGCAACCATTTAGTTTGGTTCAGCCCATGCCCATCTATATCAAATTTATGTTTTAtt > 1:875279/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |