| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 251,726 | G→A | intergenic (‑37842/+27957) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 251,726 | 0 | G | A | 100.0% | 221.4 / NA | 75 | intergenic (‑37842/+27957) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/41); total (34/41) | |||||||||||
CGGAGCGGTTGTTGGTGACAAAAGAAAATTTAGAAGAATAAAAGTGCGGTGGATTTTTAATGTGTTTTTACAATTTCCCCATGATGTTAAAAAAACGTTGAATTTTAGGCGTAAAACAGTTAATTTTTCCGCCTTTTATACTTTTATTTTTTATTGGGGGAAACCGTGCAACAAGCGAACCAAGGACAAC‑AAATTAAACCGCGTTATGAGCCGGCGGCAATCAGTAAAATTATTTTCGCCAGCCGTTGGCTGCAACTGCCGATTTATCTCGGGTTGATTATCGTGCAAGGCATTTATGCCTATAAATTTATGAAATCCCTGTGGCATTTAATTGTCAATTTACAGGAAATGGATTCCAACACCGTGATGTTGGCGGTATTGAATCTGATTGATGTTGTCATGATCGCCAATTTGCTGGTGATGGTGATTATCGGCGGGTATGAGATTTTCGTCTCCAAGCTGCGCACGCGTGGGCAT > 1/251485‑251961 | cGGAGCGGTTGTTGGTGACAAAAGAAAATTTAGAAGAATAAAAGTGCGGTGGATTTTTAATGTGTTTTTACAATTTCCCCATGATGTTAAAAAAACGTTGAATTTTAGGCGTAAAACAGTTAATTTTTCCGCCTTTTATACTTTTATTTTTTATTGGGGGAAACCGTGCAACAAGCGAACCAAGGACAAC‑AAATTAAACCGCGTTATGAGCCGGCGGCAATCAGTAAAATTATTTTCGCCAACCGTTGGCt < 1:244714/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |